Protein–RNA interactions for Protein: P10078

Zfp28, Zinc finger protein 28, mousemouse

Predictions only

Length 825 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp28P10078 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Zfp28P10078 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Zfp28P10078 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Zfp28P10078 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Zfp28P10078 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Zfp28P10078 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Zfp28P10078 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Zfp28P10078 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Zfp28P10078 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Zfp28P10078 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Zfp28P10078 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Zfp28P10078 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Zfp28P10078 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Zfp28P10078 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Zfp28P10078 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Zfp28P10078 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Zfp28P10078 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Zfp28P10078 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Zfp28P10078 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Zfp28P10078 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Zfp28P10078 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Zfp28P10078 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Zfp28P10078 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Zfp28P10078 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Zfp28P10078 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Zfp28P10078 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Zfp28P10078 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Zfp28P10078 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Zfp28P10078 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Zfp28P10078 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Zfp28P10078 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Zfp28P10078 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Zfp28P10078 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Zfp28P10078 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Zfp28P10078 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Zfp28P10078 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Zfp28P10078 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Zfp28P10078 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Zfp28P10078 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Zfp28P10078 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Zfp28P10078 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Zfp28P10078 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Zfp28P10078 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Zfp28P10078 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Zfp28P10078 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Zfp28P10078 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Zfp28P10078 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Zfp28P10078 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Zfp28P10078 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Zfp28P10078 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Zfp28P10078 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Zfp28P10078 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Zfp28P10078 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Zfp28P10078 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Zfp28P10078 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Zfp28P10078 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Zfp28P10078 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Zfp28P10078 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Zfp28P10078 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Zfp28P10078 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Zfp28P10078 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Zfp28P10078 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Zfp28P10078 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Zfp28P10078 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Zfp28P10078 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Zfp28P10078 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Zfp28P10078 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Zfp28P10078 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Zfp28P10078 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Zfp28P10078 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Zfp28P10078 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Zfp28P10078 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Zfp28P10078 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Zfp28P10078 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Zfp28P10078 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Zfp28P10078 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Zfp28P10078 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Zfp28P10078 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Zfp28P10078 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Zfp28P10078 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Zfp28P10078 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Zfp28P10078 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Zfp28P10078 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Zfp28P10078 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Zfp28P10078 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Zfp28P10078 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Zfp28P10078 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Zfp28P10078 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Zfp28P10078 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Zfp28P10078 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Zfp28P10078 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Zfp28P10078 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Zfp28P10078 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Zfp28P10078 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Zfp28P10078 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Zfp28P10078 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Zfp28P10078 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Zfp28P10078 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Zfp28P10078 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Zfp28P10078 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.4 ms