Protein–RNA interactions for Protein: P09026

Hoxb3, Homeobox protein Hox-B3, mousemouse

Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb3P09026 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Hoxb3P09026 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Hoxb3P09026 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Hoxb3P09026 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Hoxb3P09026 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Hoxb3P09026 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Hoxb3P09026 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Hoxb3P09026 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Hoxb3P09026 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Hoxb3P09026 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Hoxb3P09026 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Hoxb3P09026 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Hoxb3P09026 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Hoxb3P09026 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Hoxb3P09026 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Hoxb3P09026 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Hoxb3P09026 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Hoxb3P09026 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Hoxb3P09026 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Hoxb3P09026 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Hoxb3P09026 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Hoxb3P09026 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Hoxb3P09026 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Hoxb3P09026 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Hoxb3P09026 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Hoxb3P09026 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Hoxb3P09026 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Hoxb3P09026 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Hoxb3P09026 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Hoxb3P09026 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Hoxb3P09026 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Hoxb3P09026 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Hoxb3P09026 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Hoxb3P09026 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Hoxb3P09026 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Hoxb3P09026 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Hoxb3P09026 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Hoxb3P09026 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Hoxb3P09026 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Hoxb3P09026 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Hoxb3P09026 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Hoxb3P09026 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Hoxb3P09026 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Hoxb3P09026 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Hoxb3P09026 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Hoxb3P09026 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Hoxb3P09026 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Hoxb3P09026 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Hoxb3P09026 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Hoxb3P09026 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Hoxb3P09026 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Hoxb3P09026 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Hoxb3P09026 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Hoxb3P09026 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Hoxb3P09026 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Hoxb3P09026 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Hoxb3P09026 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Hoxb3P09026 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Hoxb3P09026 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Hoxb3P09026 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Hoxb3P09026 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Hoxb3P09026 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Hoxb3P09026 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Hoxb3P09026 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Hoxb3P09026 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Hoxb3P09026 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Hoxb3P09026 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Hoxb3P09026 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Hoxb3P09026 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Hoxb3P09026 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Hoxb3P09026 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Hoxb3P09026 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Hoxb3P09026 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Hoxb3P09026 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Hoxb3P09026 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Hoxb3P09026 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Hoxb3P09026 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Hoxb3P09026 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Hoxb3P09026 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Hoxb3P09026 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Hoxb3P09026 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Hoxb3P09026 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Hoxb3P09026 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Hoxb3P09026 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Hoxb3P09026 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Hoxb3P09026 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Hoxb3P09026 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Hoxb3P09026 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Hoxb3P09026 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Hoxb3P09026 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Hoxb3P09026 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Hoxb3P09026 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Hoxb3P09026 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Hoxb3P09026 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Hoxb3P09026 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Hoxb3P09026 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Hoxb3P09026 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Hoxb3P09026 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Hoxb3P09026 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Hoxb3P09026 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms