Protein–RNA interactions for Protein: P09021

Hoxa5, Homeobox protein Hox-A5, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa5P09021 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Hoxa5P09021 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Hoxa5P09021 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Hoxa5P09021 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Hoxa5P09021 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Hoxa5P09021 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Hoxa5P09021 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Hoxa5P09021 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Hoxa5P09021 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Hoxa5P09021 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Hoxa5P09021 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Hoxa5P09021 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Hoxa5P09021 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Hoxa5P09021 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Hoxa5P09021 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Hoxa5P09021 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Hoxa5P09021 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Hoxa5P09021 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Hoxa5P09021 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Hoxa5P09021 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Hoxa5P09021 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Hoxa5P09021 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Hoxa5P09021 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Hoxa5P09021 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Hoxa5P09021 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Hoxa5P09021 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Hoxa5P09021 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Hoxa5P09021 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
Hoxa5P09021 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Hoxa5P09021 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Hoxa5P09021 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Hoxa5P09021 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Hoxa5P09021 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Hoxa5P09021 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Hoxa5P09021 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Hoxa5P09021 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Hoxa5P09021 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Hoxa5P09021 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Hoxa5P09021 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Hoxa5P09021 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Hoxa5P09021 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Hoxa5P09021 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Hoxa5P09021 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Hoxa5P09021 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Hoxa5P09021 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Hoxa5P09021 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Hoxa5P09021 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Hoxa5P09021 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Hoxa5P09021 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Hoxa5P09021 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Hoxa5P09021 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Hoxa5P09021 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Hoxa5P09021 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Hoxa5P09021 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Hoxa5P09021 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Hoxa5P09021 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Hoxa5P09021 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Hoxa5P09021 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Hoxa5P09021 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Hoxa5P09021 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Hoxa5P09021 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Hoxa5P09021 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Hoxa5P09021 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Hoxa5P09021 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Hoxa5P09021 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Hoxa5P09021 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Hoxa5P09021 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Hoxa5P09021 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hoxa5P09021 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hoxa5P09021 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hoxa5P09021 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hoxa5P09021 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hoxa5P09021 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hoxa5P09021 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hoxa5P09021 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hoxa5P09021 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hoxa5P09021 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hoxa5P09021 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hoxa5P09021 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hoxa5P09021 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hoxa5P09021 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hoxa5P09021 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hoxa5P09021 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hoxa5P09021 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hoxa5P09021 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hoxa5P09021 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hoxa5P09021 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hoxa5P09021 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hoxa5P09021 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Hoxa5P09021 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hoxa5P09021 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hoxa5P09021 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hoxa5P09021 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hoxa5P09021 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hoxa5P09021 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hoxa5P09021 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hoxa5P09021 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hoxa5P09021 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hoxa5P09021 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hoxa5P09021 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 161.8 ms