Protein–RNA interactions for Protein: P08042

Zfp1, Zinc finger protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp1P08042 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Zfp1P08042 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Zfp1P08042 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Zfp1P08042 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Zfp1P08042 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Zfp1P08042 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Zfp1P08042 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Zfp1P08042 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Zfp1P08042 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Zfp1P08042 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Zfp1P08042 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Zfp1P08042 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Zfp1P08042 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Zfp1P08042 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Zfp1P08042 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Zfp1P08042 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Zfp1P08042 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Zfp1P08042 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Zfp1P08042 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Zfp1P08042 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Zfp1P08042 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Zfp1P08042 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Zfp1P08042 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Zfp1P08042 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Zfp1P08042 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Zfp1P08042 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Zfp1P08042 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Zfp1P08042 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Zfp1P08042 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Zfp1P08042 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Zfp1P08042 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Zfp1P08042 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Zfp1P08042 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Zfp1P08042 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Zfp1P08042 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Zfp1P08042 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Zfp1P08042 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Zfp1P08042 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Zfp1P08042 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Zfp1P08042 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Zfp1P08042 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Zfp1P08042 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Zfp1P08042 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Zfp1P08042 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Zfp1P08042 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Zfp1P08042 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Zfp1P08042 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Zfp1P08042 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Zfp1P08042 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Zfp1P08042 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Zfp1P08042 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Zfp1P08042 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Zfp1P08042 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Zfp1P08042 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Zfp1P08042 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Zfp1P08042 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Zfp1P08042 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Zfp1P08042 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Zfp1P08042 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Zfp1P08042 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Zfp1P08042 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Zfp1P08042 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Zfp1P08042 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Zfp1P08042 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Zfp1P08042 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Zfp1P08042 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Zfp1P08042 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Zfp1P08042 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Zfp1P08042 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Zfp1P08042 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Zfp1P08042 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Zfp1P08042 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Zfp1P08042 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Zfp1P08042 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Zfp1P08042 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Zfp1P08042 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Zfp1P08042 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Zfp1P08042 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Zfp1P08042 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Zfp1P08042 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Zfp1P08042 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Zfp1P08042 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Zfp1P08042 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Zfp1P08042 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Zfp1P08042 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Zfp1P08042 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Zfp1P08042 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Zfp1P08042 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Zfp1P08042 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Zfp1P08042 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Zfp1P08042 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Zfp1P08042 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Zfp1P08042 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Zfp1P08042 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Zfp1P08042 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Zfp1P08042 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Zfp1P08042 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Zfp1P08042 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Zfp1P08042 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Zfp1P08042 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.2 ms