Protein–RNA interactions for Protein: P07141

Csf1, Macrophage colony-stimulating factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csf1P07141 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Csf1P07141 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Csf1P07141 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Csf1P07141 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Csf1P07141 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Csf1P07141 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Csf1P07141 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Csf1P07141 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Csf1P07141 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Csf1P07141 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Csf1P07141 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Csf1P07141 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Csf1P07141 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Csf1P07141 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Csf1P07141 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Csf1P07141 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Csf1P07141 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Csf1P07141 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Csf1P07141 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Csf1P07141 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Csf1P07141 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Csf1P07141 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Csf1P07141 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Csf1P07141 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Csf1P07141 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Csf1P07141 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Csf1P07141 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Csf1P07141 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Csf1P07141 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Csf1P07141 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Csf1P07141 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Csf1P07141 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Csf1P07141 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Csf1P07141 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Csf1P07141 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Csf1P07141 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Csf1P07141 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Csf1P07141 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Csf1P07141 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Csf1P07141 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Csf1P07141 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Csf1P07141 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Csf1P07141 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Csf1P07141 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Csf1P07141 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Csf1P07141 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Csf1P07141 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Csf1P07141 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Csf1P07141 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Csf1P07141 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Csf1P07141 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Csf1P07141 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Csf1P07141 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Csf1P07141 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Csf1P07141 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Csf1P07141 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Csf1P07141 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Csf1P07141 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Csf1P07141 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Csf1P07141 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Csf1P07141 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Csf1P07141 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Csf1P07141 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Csf1P07141 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Csf1P07141 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Csf1P07141 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Csf1P07141 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Csf1P07141 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Csf1P07141 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Csf1P07141 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Csf1P07141 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Csf1P07141 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Csf1P07141 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Csf1P07141 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Csf1P07141 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Csf1P07141 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Csf1P07141 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Csf1P07141 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Csf1P07141 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Csf1P07141 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Csf1P07141 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Csf1P07141 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Csf1P07141 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Csf1P07141 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Csf1P07141 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Csf1P07141 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Csf1P07141 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Csf1P07141 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Csf1P07141 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Csf1P07141 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Csf1P07141 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Csf1P07141 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Csf1P07141 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Csf1P07141 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Csf1P07141 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Csf1P07141 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Csf1P07141 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Csf1P07141 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Csf1P07141 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Csf1P07141 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms