Protein–RNA interactions for Protein: P06330

Ig heavy chain V region AC38 205.12, mousemouse

Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P06330 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
P06330 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
P06330 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
P06330 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
P06330 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
P06330 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
P06330 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
P06330 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
P06330 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
P06330 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
P06330 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
P06330 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
P06330 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
P06330 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
P06330 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
P06330 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
P06330 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
P06330 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
P06330 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
P06330 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
P06330 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
P06330 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
P06330 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
P06330 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
P06330 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
P06330 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
P06330 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
P06330 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
P06330 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
P06330 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
P06330 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
P06330 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
P06330 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
P06330 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
P06330 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
P06330 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
P06330 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
P06330 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
P06330 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
P06330 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
P06330 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
P06330 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
P06330 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
P06330 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
P06330 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
P06330 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
P06330 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
P06330 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
P06330 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
P06330 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
P06330 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
P06330 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
P06330 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
P06330 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
P06330 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
P06330 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
P06330 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
P06330 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
P06330 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
P06330 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
P06330 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
P06330 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
P06330 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
P06330 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
P06330 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
P06330 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
P06330 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
P06330 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
P06330 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
P06330 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
P06330 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
P06330 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
P06330 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
P06330 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
P06330 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
P06330 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
P06330 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
P06330 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
P06330 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
P06330 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
P06330 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
P06330 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
P06330 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
P06330 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
P06330 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
P06330 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
P06330 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
P06330 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
P06330 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
P06330 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
P06330 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
P06330 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
P06330 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
P06330 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
P06330 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
P06330 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
P06330 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
P06330 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
P06330 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
P06330 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms