Protein–RNA interactions for Protein: P01823

Ig heavy chain V region 36-60, mousemouse

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01823 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
P01823 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
P01823 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
P01823 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
P01823 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
P01823 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
P01823 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
P01823 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
P01823 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
P01823 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
P01823 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
P01823 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
P01823 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
P01823 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01823 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01823 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01823 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01823 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01823 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01823 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01823 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
P01823 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01823 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01823 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01823 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01823 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01823 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01823 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01823 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
P01823 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01823 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01823 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01823 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
P01823 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01823 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01823 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
P01823 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01823 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01823 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01823 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01823 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01823 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01823 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01823 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01823 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01823 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01823 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01823 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01823 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01823 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01823 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01823 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01823 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01823 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01823 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01823 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01823 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01823 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01823 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01823 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01823 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01823 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01823 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01823 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01823 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
P01823 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01823 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01823 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01823 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01823 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01823 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01823 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01823 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01823 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01823 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01823 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01823 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01823 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01823 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01823 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01823 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01823 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01823 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01823 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01823 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01823 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01823 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01823 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01823 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01823 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01823 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01823 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01823 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01823 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01823 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01823 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
P01823 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01823 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01823 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01823 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87.9 ms