Protein–RNA interactions for Protein: P01679

Ig kappa chain V-VI region J539, mousemouse

Predictions only

Length 107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01679 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
P01679 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
P01679 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
P01679 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
P01679 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
P01679 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
P01679 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
P01679 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
P01679 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
P01679 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
P01679 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
P01679 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
P01679 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
P01679 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
P01679 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
P01679 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
P01679 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
P01679 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
P01679 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
P01679 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
P01679 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
P01679 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
P01679 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
P01679 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
P01679 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
P01679 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
P01679 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
P01679 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
P01679 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
P01679 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
P01679 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
P01679 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
P01679 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
P01679 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
P01679 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
P01679 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
P01679 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
P01679 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
P01679 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
P01679 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
P01679 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
P01679 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
P01679 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
P01679 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
P01679 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
P01679 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
P01679 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
P01679 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
P01679 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
P01679 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
P01679 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
P01679 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
P01679 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
P01679 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
P01679 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
P01679 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
P01679 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
P01679 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
P01679 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
P01679 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
P01679 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
P01679 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
P01679 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
P01679 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
P01679 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
P01679 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
P01679 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
P01679 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
P01679 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
P01679 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
P01679 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
P01679 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
P01679 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
P01679 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
P01679 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
P01679 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
P01679 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
P01679 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
P01679 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
P01679 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
P01679 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
P01679 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
P01679 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
P01679 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
P01679 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
P01679 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
P01679 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
P01679 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
P01679 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
P01679 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
P01679 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
P01679 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
P01679 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
P01679 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
P01679 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
P01679 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
P01679 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
P01679 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
P01679 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
P01679 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.7 ms