Protein–RNA interactions for Protein: O88983

Stx8, Syntaxin-8, mousemouse

Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx8O88983 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Stx8O88983 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Stx8O88983 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Stx8O88983 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Stx8O88983 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Stx8O88983 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Stx8O88983 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Stx8O88983 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
Stx8O88983 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Stx8O88983 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Stx8O88983 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Stx8O88983 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Stx8O88983 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Stx8O88983 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Stx8O88983 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Stx8O88983 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Stx8O88983 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Stx8O88983 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Stx8O88983 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Stx8O88983 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Stx8O88983 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Stx8O88983 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Stx8O88983 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Stx8O88983 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Stx8O88983 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Stx8O88983 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Stx8O88983 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Stx8O88983 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Stx8O88983 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Stx8O88983 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Stx8O88983 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Stx8O88983 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Stx8O88983 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Stx8O88983 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Stx8O88983 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Stx8O88983 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Stx8O88983 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Stx8O88983 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Stx8O88983 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Stx8O88983 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Stx8O88983 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Stx8O88983 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Stx8O88983 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Stx8O88983 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Stx8O88983 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Stx8O88983 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Stx8O88983 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Stx8O88983 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Stx8O88983 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Stx8O88983 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Stx8O88983 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Stx8O88983 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Stx8O88983 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Stx8O88983 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Stx8O88983 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
Stx8O88983 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Stx8O88983 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Stx8O88983 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Stx8O88983 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Stx8O88983 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Stx8O88983 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Stx8O88983 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Stx8O88983 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Stx8O88983 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Stx8O88983 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Stx8O88983 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Stx8O88983 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Stx8O88983 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Stx8O88983 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Stx8O88983 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Stx8O88983 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Stx8O88983 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Stx8O88983 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Stx8O88983 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Stx8O88983 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
Stx8O88983 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Stx8O88983 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Stx8O88983 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Stx8O88983 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Stx8O88983 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Stx8O88983 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Stx8O88983 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Stx8O88983 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Stx8O88983 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Stx8O88983 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Stx8O88983 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Stx8O88983 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Stx8O88983 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Stx8O88983 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Stx8O88983 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Stx8O88983 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Stx8O88983 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Stx8O88983 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Stx8O88983 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Stx8O88983 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Stx8O88983 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Stx8O88983 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC27.57■■■□□ 2
Stx8O88983 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
Stx8O88983 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Stx8O88983 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.5 ms