Protein–RNA interactions for Protein: O88851

Rbbp9, Putative hydrolase RBBP9, mousemouse

Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp9O88851 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rbbp9O88851 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rbbp9O88851 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rbbp9O88851 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Rbbp9O88851 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Rbbp9O88851 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Rbbp9O88851 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rbbp9O88851 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rbbp9O88851 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rbbp9O88851 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rbbp9O88851 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rbbp9O88851 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rbbp9O88851 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rbbp9O88851 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rbbp9O88851 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rbbp9O88851 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rbbp9O88851 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rbbp9O88851 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rbbp9O88851 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rbbp9O88851 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Rbbp9O88851 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rbbp9O88851 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rbbp9O88851 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rbbp9O88851 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rbbp9O88851 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rbbp9O88851 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rbbp9O88851 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rbbp9O88851 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rbbp9O88851 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rbbp9O88851 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Rbbp9O88851 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rbbp9O88851 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rbbp9O88851 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rbbp9O88851 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rbbp9O88851 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rbbp9O88851 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rbbp9O88851 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rbbp9O88851 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rbbp9O88851 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rbbp9O88851 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rbbp9O88851 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rbbp9O88851 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rbbp9O88851 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rbbp9O88851 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rbbp9O88851 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rbbp9O88851 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rbbp9O88851 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rbbp9O88851 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rbbp9O88851 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rbbp9O88851 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rbbp9O88851 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rbbp9O88851 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rbbp9O88851 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rbbp9O88851 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Rbbp9O88851 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Rbbp9O88851 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rbbp9O88851 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rbbp9O88851 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Rbbp9O88851 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rbbp9O88851 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rbbp9O88851 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rbbp9O88851 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rbbp9O88851 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rbbp9O88851 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rbbp9O88851 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rbbp9O88851 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rbbp9O88851 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rbbp9O88851 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rbbp9O88851 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rbbp9O88851 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rbbp9O88851 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rbbp9O88851 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rbbp9O88851 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rbbp9O88851 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rbbp9O88851 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Rbbp9O88851 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rbbp9O88851 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rbbp9O88851 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rbbp9O88851 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rbbp9O88851 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rbbp9O88851 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rbbp9O88851 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rbbp9O88851 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rbbp9O88851 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rbbp9O88851 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Rbbp9O88851 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rbbp9O88851 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rbbp9O88851 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rbbp9O88851 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rbbp9O88851 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rbbp9O88851 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rbbp9O88851 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rbbp9O88851 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rbbp9O88851 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rbbp9O88851 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rbbp9O88851 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rbbp9O88851 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rbbp9O88851 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Rbbp9O88851 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rbbp9O88851 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms