Protein–RNA interactions for Protein: O88741

Gdap1, Ganglioside-induced differentiation-associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdap1O88741 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Gdap1O88741 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Gdap1O88741 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Gdap1O88741 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Gdap1O88741 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Gdap1O88741 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Gdap1O88741 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Gdap1O88741 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Gdap1O88741 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Gdap1O88741 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Gdap1O88741 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Gdap1O88741 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Gdap1O88741 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Gdap1O88741 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Gdap1O88741 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Gdap1O88741 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Gdap1O88741 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Gdap1O88741 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Gdap1O88741 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Gdap1O88741 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Gdap1O88741 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Gdap1O88741 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Gdap1O88741 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Gdap1O88741 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Gdap1O88741 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Gdap1O88741 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Gdap1O88741 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Gdap1O88741 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Gdap1O88741 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Gdap1O88741 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Gdap1O88741 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Gdap1O88741 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Gdap1O88741 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Gdap1O88741 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Gdap1O88741 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Gdap1O88741 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Gdap1O88741 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Gdap1O88741 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Gdap1O88741 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Gdap1O88741 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Gdap1O88741 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Gdap1O88741 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Gdap1O88741 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Gdap1O88741 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Gdap1O88741 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Gdap1O88741 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Gdap1O88741 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Gdap1O88741 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Gdap1O88741 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Gdap1O88741 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Gdap1O88741 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Gdap1O88741 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Gdap1O88741 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Gdap1O88741 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Gdap1O88741 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Gdap1O88741 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Gdap1O88741 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Gdap1O88741 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Gdap1O88741 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Gdap1O88741 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Gdap1O88741 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Gdap1O88741 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Gdap1O88741 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
Gdap1O88741 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Gdap1O88741 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Gdap1O88741 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Gdap1O88741 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Gdap1O88741 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Gdap1O88741 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Gdap1O88741 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Gdap1O88741 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Gdap1O88741 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Gdap1O88741 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Gdap1O88741 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Gdap1O88741 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Gdap1O88741 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Gdap1O88741 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Gdap1O88741 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Gdap1O88741 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Gdap1O88741 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Gdap1O88741 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Gdap1O88741 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Gdap1O88741 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Gdap1O88741 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Gdap1O88741 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Gdap1O88741 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Gdap1O88741 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Gdap1O88741 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Gdap1O88741 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Gdap1O88741 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Gdap1O88741 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Gdap1O88741 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
Gdap1O88741 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Gdap1O88741 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Gdap1O88741 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Gdap1O88741 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Gdap1O88741 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Gdap1O88741 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Gdap1O88741 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Gdap1O88741 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.1 ms