Protein–RNA interactions for Protein: O70572

Smpd2, Sphingomyelin phosphodiesterase 2, mousemouse

Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smpd2O70572 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Smpd2O70572 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Smpd2O70572 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Smpd2O70572 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Smpd2O70572 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Smpd2O70572 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Smpd2O70572 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Smpd2O70572 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Smpd2O70572 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Smpd2O70572 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Smpd2O70572 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Smpd2O70572 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Smpd2O70572 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Smpd2O70572 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Smpd2O70572 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Smpd2O70572 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
Smpd2O70572 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Smpd2O70572 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Smpd2O70572 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Smpd2O70572 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Smpd2O70572 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Smpd2O70572 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Smpd2O70572 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Smpd2O70572 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Smpd2O70572 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Smpd2O70572 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Smpd2O70572 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Smpd2O70572 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Smpd2O70572 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Smpd2O70572 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Smpd2O70572 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Smpd2O70572 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Smpd2O70572 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Smpd2O70572 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Smpd2O70572 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Smpd2O70572 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Smpd2O70572 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Smpd2O70572 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Smpd2O70572 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Smpd2O70572 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Smpd2O70572 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Smpd2O70572 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Smpd2O70572 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Smpd2O70572 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Smpd2O70572 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Smpd2O70572 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Smpd2O70572 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Smpd2O70572 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Smpd2O70572 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Smpd2O70572 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Smpd2O70572 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Smpd2O70572 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Smpd2O70572 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Smpd2O70572 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Smpd2O70572 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Smpd2O70572 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Smpd2O70572 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Smpd2O70572 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Smpd2O70572 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Smpd2O70572 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Smpd2O70572 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Smpd2O70572 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Smpd2O70572 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Smpd2O70572 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Smpd2O70572 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Smpd2O70572 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Smpd2O70572 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Smpd2O70572 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Smpd2O70572 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Smpd2O70572 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Smpd2O70572 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Smpd2O70572 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Smpd2O70572 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Smpd2O70572 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Smpd2O70572 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Smpd2O70572 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Smpd2O70572 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Smpd2O70572 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Smpd2O70572 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Smpd2O70572 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Smpd2O70572 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Smpd2O70572 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Smpd2O70572 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Smpd2O70572 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Smpd2O70572 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Smpd2O70572 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Smpd2O70572 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Smpd2O70572 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Smpd2O70572 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Smpd2O70572 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Smpd2O70572 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Smpd2O70572 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Smpd2O70572 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Smpd2O70572 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Smpd2O70572 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Smpd2O70572 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Smpd2O70572 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Smpd2O70572 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Smpd2O70572 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Smpd2O70572 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.8 ms