Protein–RNA interactions for Protein: O70405

Ulk1, Serine/threonine-protein kinase ULK1, mousemouse

Predictions only

Length 1,051 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ulk1O70405 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ulk1O70405 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ulk1O70405 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ulk1O70405 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ulk1O70405 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ulk1O70405 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Ulk1O70405 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ulk1O70405 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ulk1O70405 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ulk1O70405 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ulk1O70405 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ulk1O70405 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ulk1O70405 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ulk1O70405 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Ulk1O70405 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ulk1O70405 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Ulk1O70405 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ulk1O70405 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ulk1O70405 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ulk1O70405 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Ulk1O70405 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ulk1O70405 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ulk1O70405 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ulk1O70405 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ulk1O70405 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ulk1O70405 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ulk1O70405 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ulk1O70405 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ulk1O70405 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ulk1O70405 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ulk1O70405 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ulk1O70405 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Ulk1O70405 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ulk1O70405 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Ulk1O70405 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ulk1O70405 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ulk1O70405 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ulk1O70405 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ulk1O70405 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ulk1O70405 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ulk1O70405 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ulk1O70405 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ulk1O70405 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ulk1O70405 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ulk1O70405 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ulk1O70405 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ulk1O70405 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ulk1O70405 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ulk1O70405 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ulk1O70405 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ulk1O70405 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ulk1O70405 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ulk1O70405 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ulk1O70405 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ulk1O70405 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ulk1O70405 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Ulk1O70405 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ulk1O70405 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ulk1O70405 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ulk1O70405 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ulk1O70405 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ulk1O70405 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ulk1O70405 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Ulk1O70405 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ulk1O70405 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ulk1O70405 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ulk1O70405 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ulk1O70405 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ulk1O70405 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ulk1O70405 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ulk1O70405 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ulk1O70405 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22■■□□□ 1.11
Ulk1O70405 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Ulk1O70405 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Ulk1O70405 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ulk1O70405 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ulk1O70405 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ulk1O70405 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ulk1O70405 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ulk1O70405 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ulk1O70405 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ulk1O70405 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ulk1O70405 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ulk1O70405 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ulk1O70405 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ulk1O70405 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ulk1O70405 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ulk1O70405 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Ulk1O70405 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ulk1O70405 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ulk1O70405 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ulk1O70405 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ulk1O70405 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ulk1O70405 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ulk1O70405 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ulk1O70405 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ulk1O70405 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ulk1O70405 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ulk1O70405 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ulk1O70405 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms