Protein–RNA interactions for Protein: O70274

Ptp4a2, Protein tyrosine phosphatase type IVA 2, mousemouse

Predictions only

Length 167 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptp4a2O70274 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ptp4a2O70274 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ptp4a2O70274 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ptp4a2O70274 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ptp4a2O70274 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ptp4a2O70274 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ptp4a2O70274 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ptp4a2O70274 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ptp4a2O70274 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ptp4a2O70274 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ptp4a2O70274 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ptp4a2O70274 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ptp4a2O70274 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ptp4a2O70274 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ptp4a2O70274 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ptp4a2O70274 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ptp4a2O70274 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ptp4a2O70274 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ptp4a2O70274 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ptp4a2O70274 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ptp4a2O70274 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ptp4a2O70274 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ptp4a2O70274 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ptp4a2O70274 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ptp4a2O70274 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ptp4a2O70274 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ptp4a2O70274 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ptp4a2O70274 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ptp4a2O70274 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ptp4a2O70274 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ptp4a2O70274 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ptp4a2O70274 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ptp4a2O70274 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ptp4a2O70274 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ptp4a2O70274 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Ptp4a2O70274 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ptp4a2O70274 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ptp4a2O70274 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ptp4a2O70274 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ptp4a2O70274 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ptp4a2O70274 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ptp4a2O70274 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ptp4a2O70274 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ptp4a2O70274 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ptp4a2O70274 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ptp4a2O70274 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ptp4a2O70274 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ptp4a2O70274 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ptp4a2O70274 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ptp4a2O70274 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ptp4a2O70274 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ptp4a2O70274 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ptp4a2O70274 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ptp4a2O70274 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ptp4a2O70274 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ptp4a2O70274 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ptp4a2O70274 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ptp4a2O70274 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ptp4a2O70274 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ptp4a2O70274 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ptp4a2O70274 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ptp4a2O70274 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ptp4a2O70274 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ptp4a2O70274 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ptp4a2O70274 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ptp4a2O70274 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ptp4a2O70274 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ptp4a2O70274 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ptp4a2O70274 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ptp4a2O70274 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ptp4a2O70274 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ptp4a2O70274 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ptp4a2O70274 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ptp4a2O70274 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ptp4a2O70274 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ptp4a2O70274 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ptp4a2O70274 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ptp4a2O70274 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Ptp4a2O70274 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Ptp4a2O70274 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
Ptp4a2O70274 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ptp4a2O70274 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ptp4a2O70274 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ptp4a2O70274 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ptp4a2O70274 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ptp4a2O70274 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ptp4a2O70274 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ptp4a2O70274 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ptp4a2O70274 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ptp4a2O70274 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ptp4a2O70274 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Ptp4a2O70274 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ptp4a2O70274 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ptp4a2O70274 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ptp4a2O70274 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ptp4a2O70274 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ptp4a2O70274 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ptp4a2O70274 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ptp4a2O70274 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ptp4a2O70274 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 130.3 ms