Protein–RNA interactions for Protein: O55201

Supt5h, Transcription elongation factor SPT5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,082 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Supt5hO55201 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
Supt5hO55201 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
Supt5hO55201 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
Supt5hO55201 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
Supt5hO55201 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
Supt5hO55201 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
Supt5hO55201 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
Supt5hO55201 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
Supt5hO55201 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
Supt5hO55201 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
Supt5hO55201 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
Supt5hO55201 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC34.25■■■■□ 3.07
Supt5hO55201 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.25■■■■□ 3.07
Supt5hO55201 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
Supt5hO55201 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC34.24■■■■□ 3.07
Supt5hO55201 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
Supt5hO55201 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC34.22■■■■□ 3.07
Supt5hO55201 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
Supt5hO55201 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
Supt5hO55201 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.19■■■■□ 3.06
Supt5hO55201 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC34.19■■■■□ 3.06
Supt5hO55201 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
Supt5hO55201 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC34.18■■■■□ 3.06
Supt5hO55201 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
Supt5hO55201 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
Supt5hO55201 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
Supt5hO55201 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC34.17■■■■□ 3.06
Supt5hO55201 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
Supt5hO55201 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
Supt5hO55201 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
Supt5hO55201 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.15■■■■□ 3.06
Supt5hO55201 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
Supt5hO55201 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.14■■■■□ 3.06
Supt5hO55201 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.14■■■■□ 3.06
Supt5hO55201 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
Supt5hO55201 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
Supt5hO55201 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
Supt5hO55201 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC34.12■■■■□ 3.05
Supt5hO55201 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
Supt5hO55201 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
Supt5hO55201 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
Supt5hO55201 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
Supt5hO55201 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.1■■■■□ 3.05
Supt5hO55201 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
Supt5hO55201 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
Supt5hO55201 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
Supt5hO55201 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
Supt5hO55201 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.08■■■■□ 3.05
Supt5hO55201 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
Supt5hO55201 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
Supt5hO55201 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.07■■■■□ 3.04
Supt5hO55201 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
Supt5hO55201 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
Supt5hO55201 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
Supt5hO55201 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.06■■■■□ 3.04
Supt5hO55201 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
Supt5hO55201 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC34.06■■■■□ 3.04
Supt5hO55201 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
Supt5hO55201 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
Supt5hO55201 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.03■■■■□ 3.04
Supt5hO55201 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
Supt5hO55201 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
Supt5hO55201 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.02■■■■□ 3.04
Supt5hO55201 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
Supt5hO55201 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
Supt5hO55201 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
Supt5hO55201 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34■■■■□ 3.03
Supt5hO55201 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
Supt5hO55201 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC33.98■■■■□ 3.03
Supt5hO55201 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
Supt5hO55201 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.97■■■■□ 3.03
Supt5hO55201 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
Supt5hO55201 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
Supt5hO55201 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
Supt5hO55201 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
Supt5hO55201 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.97■■■■□ 3.03
Supt5hO55201 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC33.96■■■■□ 3.03
Supt5hO55201 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
Supt5hO55201 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
Supt5hO55201 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
Supt5hO55201 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.02
Supt5hO55201 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.02
Supt5hO55201 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC33.94■■■■□ 3.02
Supt5hO55201 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
Supt5hO55201 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
Supt5hO55201 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.93■■■■□ 3.02
Supt5hO55201 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
Supt5hO55201 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
Supt5hO55201 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
Supt5hO55201 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.9■■■■□ 3.02
Supt5hO55201 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC33.89■■■■□ 3.02
Supt5hO55201 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
Supt5hO55201 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC33.87■■■■□ 3.01
Supt5hO55201 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
Supt5hO55201 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
Supt5hO55201 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
Supt5hO55201 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
Supt5hO55201 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
Supt5hO55201 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
Supt5hO55201 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.6 ms