Protein–RNA interactions for Protein: O55028

Bckdk, [3-methyl-2-oxobutanoate dehydrogenase [lipoamide]] kinase, mitochondrial, mousemouse

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Length 412 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BckdkO55028 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
BckdkO55028 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
BckdkO55028 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
BckdkO55028 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
BckdkO55028 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
BckdkO55028 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
BckdkO55028 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
BckdkO55028 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
BckdkO55028 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22■■□□□ 1.11
BckdkO55028 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC22■■□□□ 1.11
BckdkO55028 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
BckdkO55028 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
BckdkO55028 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
BckdkO55028 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
BckdkO55028 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
BckdkO55028 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
BckdkO55028 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
BckdkO55028 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
BckdkO55028 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
BckdkO55028 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
BckdkO55028 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
BckdkO55028 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
BckdkO55028 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
BckdkO55028 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
BckdkO55028 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
BckdkO55028 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
BckdkO55028 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
BckdkO55028 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
BckdkO55028 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
BckdkO55028 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
BckdkO55028 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
BckdkO55028 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
BckdkO55028 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
BckdkO55028 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
BckdkO55028 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
BckdkO55028 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
BckdkO55028 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
BckdkO55028 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
BckdkO55028 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
BckdkO55028 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
BckdkO55028 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
BckdkO55028 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
BckdkO55028 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
BckdkO55028 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
BckdkO55028 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
BckdkO55028 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
BckdkO55028 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
BckdkO55028 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
BckdkO55028 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
BckdkO55028 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
BckdkO55028 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
BckdkO55028 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
BckdkO55028 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
BckdkO55028 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
BckdkO55028 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
BckdkO55028 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
BckdkO55028 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
BckdkO55028 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
BckdkO55028 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
BckdkO55028 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
BckdkO55028 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
BckdkO55028 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
BckdkO55028 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
BckdkO55028 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
BckdkO55028 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
BckdkO55028 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
BckdkO55028 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
BckdkO55028 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
BckdkO55028 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
BckdkO55028 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
BckdkO55028 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
BckdkO55028 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
BckdkO55028 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
BckdkO55028 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
BckdkO55028 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
BckdkO55028 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
BckdkO55028 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
BckdkO55028 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
BckdkO55028 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
BckdkO55028 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
BckdkO55028 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
BckdkO55028 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
BckdkO55028 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
BckdkO55028 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
BckdkO55028 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
BckdkO55028 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
BckdkO55028 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
BckdkO55028 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
BckdkO55028 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
BckdkO55028 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
BckdkO55028 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
BckdkO55028 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
BckdkO55028 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
BckdkO55028 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
BckdkO55028 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
BckdkO55028 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
BckdkO55028 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
BckdkO55028 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
BckdkO55028 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
BckdkO55028 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms