Protein–RNA interactions for Protein: O54864

Suv39h1, Histone-lysine N-methyltransferase SUV39H1, mousemouse

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Suv39h1O54864 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Suv39h1O54864 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Suv39h1O54864 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Suv39h1O54864 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Suv39h1O54864 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Suv39h1O54864 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Suv39h1O54864 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Suv39h1O54864 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Suv39h1O54864 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Suv39h1O54864 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Suv39h1O54864 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Suv39h1O54864 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Suv39h1O54864 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Suv39h1O54864 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Suv39h1O54864 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Suv39h1O54864 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Suv39h1O54864 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Suv39h1O54864 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Suv39h1O54864 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Suv39h1O54864 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Suv39h1O54864 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Suv39h1O54864 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Suv39h1O54864 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Suv39h1O54864 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Suv39h1O54864 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Suv39h1O54864 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Suv39h1O54864 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Suv39h1O54864 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Suv39h1O54864 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Suv39h1O54864 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Suv39h1O54864 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Suv39h1O54864 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Suv39h1O54864 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Suv39h1O54864 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Suv39h1O54864 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Suv39h1O54864 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Suv39h1O54864 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Suv39h1O54864 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Suv39h1O54864 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Suv39h1O54864 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Suv39h1O54864 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Suv39h1O54864 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Suv39h1O54864 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Suv39h1O54864 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Suv39h1O54864 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Suv39h1O54864 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Suv39h1O54864 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Suv39h1O54864 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Suv39h1O54864 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Suv39h1O54864 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Suv39h1O54864 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Suv39h1O54864 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Suv39h1O54864 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Suv39h1O54864 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Suv39h1O54864 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Suv39h1O54864 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Suv39h1O54864 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Suv39h1O54864 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Suv39h1O54864 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Suv39h1O54864 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Suv39h1O54864 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Suv39h1O54864 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Suv39h1O54864 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Suv39h1O54864 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Suv39h1O54864 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Suv39h1O54864 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Suv39h1O54864 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Suv39h1O54864 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Suv39h1O54864 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Suv39h1O54864 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Suv39h1O54864 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Suv39h1O54864 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Suv39h1O54864 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Suv39h1O54864 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Suv39h1O54864 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Suv39h1O54864 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Suv39h1O54864 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Suv39h1O54864 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Suv39h1O54864 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Suv39h1O54864 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Suv39h1O54864 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Suv39h1O54864 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Suv39h1O54864 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Suv39h1O54864 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Suv39h1O54864 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Suv39h1O54864 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Suv39h1O54864 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Suv39h1O54864 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Suv39h1O54864 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Suv39h1O54864 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Suv39h1O54864 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Suv39h1O54864 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Suv39h1O54864 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Suv39h1O54864 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Suv39h1O54864 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Suv39h1O54864 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Suv39h1O54864 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Suv39h1O54864 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Suv39h1O54864 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Suv39h1O54864 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.5 ms