Protein–RNA interactions for Protein: O35930

Gp1ba, Platelet glycoprotein Ib alpha chain, mousemouse

Predictions only

Length 734 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gp1baO35930 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gp1baO35930 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gp1baO35930 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gp1baO35930 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gp1baO35930 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gp1baO35930 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gp1baO35930 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gp1baO35930 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gp1baO35930 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gp1baO35930 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gp1baO35930 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gp1baO35930 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Gp1baO35930 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Gp1baO35930 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gp1baO35930 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gp1baO35930 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gp1baO35930 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gp1baO35930 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gp1baO35930 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gp1baO35930 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gp1baO35930 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gp1baO35930 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gp1baO35930 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gp1baO35930 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gp1baO35930 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gp1baO35930 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gp1baO35930 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gp1baO35930 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gp1baO35930 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gp1baO35930 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gp1baO35930 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gp1baO35930 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gp1baO35930 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Gp1baO35930 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Gp1baO35930 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Gp1baO35930 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gp1baO35930 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gp1baO35930 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gp1baO35930 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gp1baO35930 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gp1baO35930 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gp1baO35930 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gp1baO35930 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gp1baO35930 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Gp1baO35930 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Gp1baO35930 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Gp1baO35930 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Gp1baO35930 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Gp1baO35930 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Gp1baO35930 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Gp1baO35930 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Gp1baO35930 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Gp1baO35930 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Gp1baO35930 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Gp1baO35930 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Gp1baO35930 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Gp1baO35930 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gp1baO35930 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gp1baO35930 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gp1baO35930 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gp1baO35930 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gp1baO35930 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Gp1baO35930 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Gp1baO35930 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Gp1baO35930 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Gp1baO35930 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Gp1baO35930 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Gp1baO35930 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Gp1baO35930 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Gp1baO35930 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Gp1baO35930 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Gp1baO35930 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Gp1baO35930 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gp1baO35930 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gp1baO35930 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gp1baO35930 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Gp1baO35930 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Gp1baO35930 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Gp1baO35930 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Gp1baO35930 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Gp1baO35930 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
Gp1baO35930 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Gp1baO35930 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Gp1baO35930 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Gp1baO35930 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Gp1baO35930 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Gp1baO35930 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Gp1baO35930 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Gp1baO35930 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Gp1baO35930 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Gp1baO35930 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Gp1baO35930 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Gp1baO35930 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Gp1baO35930 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Gp1baO35930 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Gp1baO35930 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Gp1baO35930 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Gp1baO35930 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Gp1baO35930 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Gp1baO35930 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.4 ms