Protein–RNA interactions for Protein: O35912

Emp3, Epithelial membrane protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 163 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Emp3O35912 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Emp3O35912 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Emp3O35912 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Emp3O35912 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Emp3O35912 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Emp3O35912 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Emp3O35912 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Emp3O35912 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Emp3O35912 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Emp3O35912 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Emp3O35912 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Emp3O35912 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Emp3O35912 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Emp3O35912 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Emp3O35912 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Emp3O35912 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Emp3O35912 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Emp3O35912 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Emp3O35912 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Emp3O35912 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Emp3O35912 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Emp3O35912 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Emp3O35912 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Emp3O35912 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Emp3O35912 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Emp3O35912 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Emp3O35912 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Emp3O35912 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Emp3O35912 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Emp3O35912 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Emp3O35912 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Emp3O35912 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Emp3O35912 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Emp3O35912 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Emp3O35912 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Emp3O35912 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Emp3O35912 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Emp3O35912 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Emp3O35912 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Emp3O35912 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Emp3O35912 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Emp3O35912 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Emp3O35912 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Emp3O35912 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Emp3O35912 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Emp3O35912 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Emp3O35912 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Emp3O35912 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Emp3O35912 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Emp3O35912 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Emp3O35912 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Emp3O35912 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Emp3O35912 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Emp3O35912 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Emp3O35912 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Emp3O35912 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Emp3O35912 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Emp3O35912 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Emp3O35912 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Emp3O35912 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Emp3O35912 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Emp3O35912 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Emp3O35912 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Emp3O35912 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Emp3O35912 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Emp3O35912 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Emp3O35912 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Emp3O35912 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Emp3O35912 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Emp3O35912 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Emp3O35912 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Emp3O35912 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Emp3O35912 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Emp3O35912 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Emp3O35912 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Emp3O35912 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Emp3O35912 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Emp3O35912 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Emp3O35912 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Emp3O35912 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Emp3O35912 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Emp3O35912 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Emp3O35912 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Emp3O35912 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Emp3O35912 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Emp3O35912 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Emp3O35912 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Emp3O35912 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Emp3O35912 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Emp3O35912 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Emp3O35912 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Emp3O35912 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Emp3O35912 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Emp3O35912 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Emp3O35912 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Emp3O35912 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Emp3O35912 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Emp3O35912 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Emp3O35912 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Emp3O35912 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.3 ms