Protein–RNA interactions for Protein: O35604

Npc1, Niemann-Pick C1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,277 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Npc1O35604 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Npc1O35604 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Npc1O35604 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Npc1O35604 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Npc1O35604 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Npc1O35604 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Npc1O35604 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Npc1O35604 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Npc1O35604 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Npc1O35604 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Npc1O35604 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Npc1O35604 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Npc1O35604 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Npc1O35604 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Npc1O35604 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Npc1O35604 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Npc1O35604 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Npc1O35604 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Npc1O35604 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Npc1O35604 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Npc1O35604 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Npc1O35604 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Npc1O35604 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Npc1O35604 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Npc1O35604 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Npc1O35604 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Npc1O35604 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Npc1O35604 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Npc1O35604 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Npc1O35604 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Npc1O35604 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Npc1O35604 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Npc1O35604 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Npc1O35604 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Npc1O35604 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Npc1O35604 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Npc1O35604 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Npc1O35604 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Npc1O35604 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Npc1O35604 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Npc1O35604 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Npc1O35604 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Npc1O35604 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Npc1O35604 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Npc1O35604 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Npc1O35604 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Npc1O35604 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Npc1O35604 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Npc1O35604 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Npc1O35604 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Npc1O35604 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Npc1O35604 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Npc1O35604 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Npc1O35604 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Npc1O35604 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Npc1O35604 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Npc1O35604 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Npc1O35604 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Npc1O35604 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Npc1O35604 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Npc1O35604 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Npc1O35604 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Npc1O35604 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Npc1O35604 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Npc1O35604 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Npc1O35604 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Npc1O35604 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Npc1O35604 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Npc1O35604 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Npc1O35604 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Npc1O35604 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Npc1O35604 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Npc1O35604 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Npc1O35604 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Npc1O35604 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Npc1O35604 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Npc1O35604 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Npc1O35604 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Npc1O35604 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Npc1O35604 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Npc1O35604 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Npc1O35604 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Npc1O35604 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Npc1O35604 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Npc1O35604 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Npc1O35604 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Npc1O35604 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Npc1O35604 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Npc1O35604 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Npc1O35604 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Npc1O35604 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Npc1O35604 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Npc1O35604 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Npc1O35604 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Npc1O35604 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Npc1O35604 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Npc1O35604 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Npc1O35604 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Npc1O35604 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Npc1O35604 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms