Protein–RNA interactions for Protein: O35464

Sema6a, Semaphorin-6A, mousemouse

Predictions only

Length 1,031 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema6aO35464 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sema6aO35464 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sema6aO35464 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sema6aO35464 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sema6aO35464 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sema6aO35464 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sema6aO35464 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sema6aO35464 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Sema6aO35464 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Sema6aO35464 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Sema6aO35464 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Sema6aO35464 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Sema6aO35464 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Sema6aO35464 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Sema6aO35464 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sema6aO35464 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sema6aO35464 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sema6aO35464 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sema6aO35464 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sema6aO35464 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sema6aO35464 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sema6aO35464 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sema6aO35464 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sema6aO35464 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sema6aO35464 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sema6aO35464 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sema6aO35464 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Sema6aO35464 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sema6aO35464 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sema6aO35464 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Sema6aO35464 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sema6aO35464 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sema6aO35464 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sema6aO35464 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sema6aO35464 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sema6aO35464 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Sema6aO35464 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sema6aO35464 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sema6aO35464 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sema6aO35464 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sema6aO35464 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sema6aO35464 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sema6aO35464 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sema6aO35464 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sema6aO35464 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sema6aO35464 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sema6aO35464 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sema6aO35464 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sema6aO35464 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
Sema6aO35464 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Sema6aO35464 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
Sema6aO35464 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
Sema6aO35464 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sema6aO35464 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sema6aO35464 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sema6aO35464 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Sema6aO35464 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sema6aO35464 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sema6aO35464 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sema6aO35464 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sema6aO35464 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sema6aO35464 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sema6aO35464 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sema6aO35464 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sema6aO35464 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sema6aO35464 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sema6aO35464 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sema6aO35464 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sema6aO35464 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sema6aO35464 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sema6aO35464 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sema6aO35464 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sema6aO35464 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sema6aO35464 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sema6aO35464 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sema6aO35464 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sema6aO35464 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Sema6aO35464 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sema6aO35464 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Sema6aO35464 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sema6aO35464 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sema6aO35464 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sema6aO35464 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sema6aO35464 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sema6aO35464 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sema6aO35464 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sema6aO35464 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sema6aO35464 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sema6aO35464 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sema6aO35464 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sema6aO35464 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sema6aO35464 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sema6aO35464 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sema6aO35464 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sema6aO35464 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sema6aO35464 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sema6aO35464 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sema6aO35464 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sema6aO35464 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Sema6aO35464 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms