Protein–RNA interactions for Protein: O35426

Xbp1, X-box-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xbp1O35426 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Xbp1O35426 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Xbp1O35426 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Xbp1O35426 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Xbp1O35426 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Xbp1O35426 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Xbp1O35426 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Xbp1O35426 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Xbp1O35426 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Xbp1O35426 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Xbp1O35426 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Xbp1O35426 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Xbp1O35426 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Xbp1O35426 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Xbp1O35426 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Xbp1O35426 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Xbp1O35426 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Xbp1O35426 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Xbp1O35426 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Xbp1O35426 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Xbp1O35426 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Xbp1O35426 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Xbp1O35426 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Xbp1O35426 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Xbp1O35426 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Xbp1O35426 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Xbp1O35426 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Xbp1O35426 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Xbp1O35426 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Xbp1O35426 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Xbp1O35426 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Xbp1O35426 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Xbp1O35426 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Xbp1O35426 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Xbp1O35426 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Xbp1O35426 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Xbp1O35426 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Xbp1O35426 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Xbp1O35426 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Xbp1O35426 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Xbp1O35426 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Xbp1O35426 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Xbp1O35426 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Xbp1O35426 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Xbp1O35426 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Xbp1O35426 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Xbp1O35426 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Xbp1O35426 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Xbp1O35426 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Xbp1O35426 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Xbp1O35426 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Xbp1O35426 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Xbp1O35426 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Xbp1O35426 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Xbp1O35426 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Xbp1O35426 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Xbp1O35426 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Xbp1O35426 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Xbp1O35426 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Xbp1O35426 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Xbp1O35426 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Xbp1O35426 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Xbp1O35426 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Xbp1O35426 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Xbp1O35426 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Xbp1O35426 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Xbp1O35426 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Xbp1O35426 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Xbp1O35426 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Xbp1O35426 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Xbp1O35426 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Xbp1O35426 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Xbp1O35426 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Xbp1O35426 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Xbp1O35426 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Xbp1O35426 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Xbp1O35426 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Xbp1O35426 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Xbp1O35426 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Xbp1O35426 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Xbp1O35426 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Xbp1O35426 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Xbp1O35426 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Xbp1O35426 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Xbp1O35426 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Xbp1O35426 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Xbp1O35426 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Xbp1O35426 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Xbp1O35426 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Xbp1O35426 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Xbp1O35426 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Xbp1O35426 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Xbp1O35426 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Xbp1O35426 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Xbp1O35426 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Xbp1O35426 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Xbp1O35426 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Xbp1O35426 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Xbp1O35426 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Xbp1O35426 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms