Protein–RNA interactions for Protein: O19441

H2-Q1, Histocompatibility 2, Q region locus 1, mousemouse

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Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Q1O19441 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
H2-Q1O19441 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
H2-Q1O19441 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
H2-Q1O19441 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
H2-Q1O19441 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
H2-Q1O19441 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
H2-Q1O19441 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
H2-Q1O19441 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
H2-Q1O19441 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
H2-Q1O19441 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
H2-Q1O19441 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
H2-Q1O19441 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
H2-Q1O19441 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
H2-Q1O19441 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
H2-Q1O19441 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
H2-Q1O19441 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
H2-Q1O19441 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
H2-Q1O19441 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
H2-Q1O19441 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
H2-Q1O19441 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
H2-Q1O19441 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
H2-Q1O19441 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
H2-Q1O19441 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
H2-Q1O19441 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
H2-Q1O19441 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
H2-Q1O19441 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
H2-Q1O19441 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
H2-Q1O19441 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
H2-Q1O19441 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
H2-Q1O19441 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
H2-Q1O19441 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
H2-Q1O19441 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
H2-Q1O19441 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
H2-Q1O19441 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
H2-Q1O19441 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
H2-Q1O19441 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
H2-Q1O19441 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
H2-Q1O19441 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
H2-Q1O19441 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
H2-Q1O19441 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
H2-Q1O19441 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
H2-Q1O19441 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
H2-Q1O19441 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
H2-Q1O19441 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
H2-Q1O19441 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
H2-Q1O19441 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
H2-Q1O19441 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
H2-Q1O19441 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
H2-Q1O19441 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
H2-Q1O19441 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
H2-Q1O19441 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
H2-Q1O19441 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
H2-Q1O19441 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
H2-Q1O19441 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
H2-Q1O19441 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
H2-Q1O19441 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
H2-Q1O19441 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
H2-Q1O19441 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
H2-Q1O19441 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
H2-Q1O19441 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
H2-Q1O19441 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
H2-Q1O19441 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
H2-Q1O19441 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
H2-Q1O19441 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
H2-Q1O19441 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
H2-Q1O19441 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
H2-Q1O19441 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
H2-Q1O19441 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
H2-Q1O19441 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
H2-Q1O19441 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
H2-Q1O19441 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
H2-Q1O19441 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
H2-Q1O19441 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
H2-Q1O19441 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
H2-Q1O19441 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
H2-Q1O19441 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
H2-Q1O19441 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
H2-Q1O19441 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
H2-Q1O19441 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
H2-Q1O19441 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
H2-Q1O19441 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
H2-Q1O19441 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
H2-Q1O19441 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
H2-Q1O19441 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
H2-Q1O19441 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
H2-Q1O19441 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
H2-Q1O19441 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
H2-Q1O19441 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
H2-Q1O19441 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
H2-Q1O19441 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
H2-Q1O19441 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
H2-Q1O19441 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
H2-Q1O19441 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
H2-Q1O19441 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
H2-Q1O19441 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
H2-Q1O19441 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
H2-Q1O19441 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
H2-Q1O19441 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
H2-Q1O19441 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
H2-Q1O19441 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
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