Protein–RNA interactions for Protein: O08786

Cckar, Cholecystokinin receptor type A, mousemouse

Predictions only

Length 436 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CckarO08786 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CckarO08786 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CckarO08786 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CckarO08786 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CckarO08786 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CckarO08786 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CckarO08786 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CckarO08786 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
CckarO08786 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CckarO08786 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CckarO08786 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CckarO08786 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
CckarO08786 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CckarO08786 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CckarO08786 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CckarO08786 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CckarO08786 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CckarO08786 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CckarO08786 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CckarO08786 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CckarO08786 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CckarO08786 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CckarO08786 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CckarO08786 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CckarO08786 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CckarO08786 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
CckarO08786 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CckarO08786 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CckarO08786 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CckarO08786 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CckarO08786 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CckarO08786 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CckarO08786 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CckarO08786 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CckarO08786 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CckarO08786 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CckarO08786 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CckarO08786 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CckarO08786 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CckarO08786 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CckarO08786 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
CckarO08786 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CckarO08786 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CckarO08786 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CckarO08786 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CckarO08786 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CckarO08786 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CckarO08786 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CckarO08786 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CckarO08786 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CckarO08786 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CckarO08786 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CckarO08786 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CckarO08786 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CckarO08786 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CckarO08786 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CckarO08786 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CckarO08786 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CckarO08786 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CckarO08786 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CckarO08786 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CckarO08786 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CckarO08786 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CckarO08786 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CckarO08786 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CckarO08786 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
CckarO08786 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CckarO08786 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CckarO08786 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CckarO08786 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
CckarO08786 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CckarO08786 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CckarO08786 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CckarO08786 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CckarO08786 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CckarO08786 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CckarO08786 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CckarO08786 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CckarO08786 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CckarO08786 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CckarO08786 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CckarO08786 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CckarO08786 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CckarO08786 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CckarO08786 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CckarO08786 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CckarO08786 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CckarO08786 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CckarO08786 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CckarO08786 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CckarO08786 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CckarO08786 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CckarO08786 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CckarO08786 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CckarO08786 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CckarO08786 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CckarO08786 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CckarO08786 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CckarO08786 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CckarO08786 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms