Protein–RNA interactions for Protein: O08601

Mttp, Microsomal triglyceride transfer protein large subunit, mousemouse

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Length 894 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MttpO08601 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MttpO08601 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MttpO08601 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MttpO08601 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MttpO08601 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MttpO08601 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.51
MttpO08601 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
MttpO08601 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
MttpO08601 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MttpO08601 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MttpO08601 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MttpO08601 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
MttpO08601 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MttpO08601 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MttpO08601 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MttpO08601 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
MttpO08601 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MttpO08601 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
MttpO08601 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
MttpO08601 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MttpO08601 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
MttpO08601 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MttpO08601 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MttpO08601 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MttpO08601 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MttpO08601 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MttpO08601 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MttpO08601 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MttpO08601 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MttpO08601 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
MttpO08601 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MttpO08601 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MttpO08601 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MttpO08601 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MttpO08601 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
MttpO08601 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
MttpO08601 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
MttpO08601 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
MttpO08601 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC24.33■■□□□ 1.48
MttpO08601 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
MttpO08601 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MttpO08601 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MttpO08601 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MttpO08601 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MttpO08601 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MttpO08601 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MttpO08601 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MttpO08601 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MttpO08601 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MttpO08601 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MttpO08601 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MttpO08601 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MttpO08601 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MttpO08601 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MttpO08601 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MttpO08601 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MttpO08601 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MttpO08601 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MttpO08601 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MttpO08601 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MttpO08601 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MttpO08601 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MttpO08601 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MttpO08601 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MttpO08601 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MttpO08601 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MttpO08601 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MttpO08601 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MttpO08601 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MttpO08601 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MttpO08601 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MttpO08601 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MttpO08601 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MttpO08601 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MttpO08601 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MttpO08601 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MttpO08601 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MttpO08601 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MttpO08601 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MttpO08601 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MttpO08601 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MttpO08601 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
MttpO08601 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MttpO08601 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MttpO08601 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MttpO08601 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MttpO08601 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
MttpO08601 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MttpO08601 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MttpO08601 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MttpO08601 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MttpO08601 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MttpO08601 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
MttpO08601 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MttpO08601 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MttpO08601 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MttpO08601 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MttpO08601 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MttpO08601 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MttpO08601 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
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