Protein–RNA interactions for Protein: O08576

Rundc3a, RUN domain-containing protein 3A, mousemouse

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rundc3aO08576 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rundc3aO08576 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rundc3aO08576 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rundc3aO08576 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rundc3aO08576 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rundc3aO08576 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rundc3aO08576 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rundc3aO08576 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rundc3aO08576 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rundc3aO08576 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rundc3aO08576 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rundc3aO08576 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rundc3aO08576 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Rundc3aO08576 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rundc3aO08576 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rundc3aO08576 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rundc3aO08576 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rundc3aO08576 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rundc3aO08576 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rundc3aO08576 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rundc3aO08576 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rundc3aO08576 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rundc3aO08576 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rundc3aO08576 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rundc3aO08576 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rundc3aO08576 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Rundc3aO08576 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rundc3aO08576 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rundc3aO08576 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rundc3aO08576 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rundc3aO08576 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rundc3aO08576 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rundc3aO08576 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rundc3aO08576 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rundc3aO08576 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rundc3aO08576 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rundc3aO08576 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rundc3aO08576 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Rundc3aO08576 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Rundc3aO08576 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rundc3aO08576 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rundc3aO08576 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rundc3aO08576 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rundc3aO08576 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Rundc3aO08576 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rundc3aO08576 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rundc3aO08576 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Rundc3aO08576 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Rundc3aO08576 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rundc3aO08576 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rundc3aO08576 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rundc3aO08576 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rundc3aO08576 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Rundc3aO08576 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rundc3aO08576 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rundc3aO08576 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rundc3aO08576 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rundc3aO08576 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rundc3aO08576 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rundc3aO08576 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rundc3aO08576 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rundc3aO08576 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Rundc3aO08576 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rundc3aO08576 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rundc3aO08576 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Rundc3aO08576 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Rundc3aO08576 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rundc3aO08576 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rundc3aO08576 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rundc3aO08576 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rundc3aO08576 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Rundc3aO08576 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rundc3aO08576 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rundc3aO08576 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rundc3aO08576 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rundc3aO08576 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rundc3aO08576 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rundc3aO08576 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rundc3aO08576 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rundc3aO08576 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rundc3aO08576 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rundc3aO08576 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rundc3aO08576 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rundc3aO08576 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rundc3aO08576 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rundc3aO08576 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rundc3aO08576 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rundc3aO08576 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Rundc3aO08576 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rundc3aO08576 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rundc3aO08576 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rundc3aO08576 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rundc3aO08576 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rundc3aO08576 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rundc3aO08576 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rundc3aO08576 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rundc3aO08576 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rundc3aO08576 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rundc3aO08576 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rundc3aO08576 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.4 ms