Protein–RNA interactions for Protein: M0QW81

Gm3488, Predicted gene, 3488, mousemouse

Predictions only

Length 238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3488M0QW81 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gm3488M0QW81 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gm3488M0QW81 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gm3488M0QW81 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gm3488M0QW81 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gm3488M0QW81 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gm3488M0QW81 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gm3488M0QW81 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gm3488M0QW81 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gm3488M0QW81 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gm3488M0QW81 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gm3488M0QW81 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gm3488M0QW81 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gm3488M0QW81 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Gm3488M0QW81 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gm3488M0QW81 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Gm3488M0QW81 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Gm3488M0QW81 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Gm3488M0QW81 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gm3488M0QW81 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gm3488M0QW81 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gm3488M0QW81 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Gm3488M0QW81 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gm3488M0QW81 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gm3488M0QW81 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gm3488M0QW81 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gm3488M0QW81 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gm3488M0QW81 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gm3488M0QW81 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Gm3488M0QW81 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Gm3488M0QW81 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Gm3488M0QW81 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Gm3488M0QW81 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gm3488M0QW81 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gm3488M0QW81 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gm3488M0QW81 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gm3488M0QW81 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gm3488M0QW81 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gm3488M0QW81 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gm3488M0QW81 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gm3488M0QW81 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gm3488M0QW81 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gm3488M0QW81 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gm3488M0QW81 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gm3488M0QW81 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gm3488M0QW81 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Gm3488M0QW81 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Gm3488M0QW81 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Gm3488M0QW81 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Gm3488M0QW81 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Gm3488M0QW81 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Gm3488M0QW81 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Gm3488M0QW81 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Gm3488M0QW81 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Gm3488M0QW81 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Gm3488M0QW81 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Gm3488M0QW81 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gm3488M0QW81 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gm3488M0QW81 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gm3488M0QW81 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gm3488M0QW81 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gm3488M0QW81 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Gm3488M0QW81 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Gm3488M0QW81 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Gm3488M0QW81 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Gm3488M0QW81 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gm3488M0QW81 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gm3488M0QW81 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gm3488M0QW81 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gm3488M0QW81 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Gm3488M0QW81 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Gm3488M0QW81 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Gm3488M0QW81 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Gm3488M0QW81 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Gm3488M0QW81 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Gm3488M0QW81 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Gm3488M0QW81 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Gm3488M0QW81 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Gm3488M0QW81 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Gm3488M0QW81 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Gm3488M0QW81 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Gm3488M0QW81 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Gm3488M0QW81 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Gm3488M0QW81 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Gm3488M0QW81 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Gm3488M0QW81 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Gm3488M0QW81 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Gm3488M0QW81 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Gm3488M0QW81 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Gm3488M0QW81 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Gm3488M0QW81 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Gm3488M0QW81 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Gm3488M0QW81 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Gm3488M0QW81 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Gm3488M0QW81 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Gm3488M0QW81 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Gm3488M0QW81 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Gm3488M0QW81 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Gm3488M0QW81 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Gm3488M0QW81 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.5 ms