Protein–RNA interactions for Protein: L7N2E3

Gm8050, Predicted gene 8050, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8050L7N2E3 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gm8050L7N2E3 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gm8050L7N2E3 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gm8050L7N2E3 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gm8050L7N2E3 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gm8050L7N2E3 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gm8050L7N2E3 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gm8050L7N2E3 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gm8050L7N2E3 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Gm8050L7N2E3 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gm8050L7N2E3 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gm8050L7N2E3 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gm8050L7N2E3 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gm8050L7N2E3 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gm8050L7N2E3 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gm8050L7N2E3 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gm8050L7N2E3 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gm8050L7N2E3 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gm8050L7N2E3 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gm8050L7N2E3 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gm8050L7N2E3 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gm8050L7N2E3 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gm8050L7N2E3 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gm8050L7N2E3 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Gm8050L7N2E3 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gm8050L7N2E3 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gm8050L7N2E3 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gm8050L7N2E3 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gm8050L7N2E3 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gm8050L7N2E3 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gm8050L7N2E3 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gm8050L7N2E3 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gm8050L7N2E3 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gm8050L7N2E3 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gm8050L7N2E3 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gm8050L7N2E3 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gm8050L7N2E3 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gm8050L7N2E3 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gm8050L7N2E3 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gm8050L7N2E3 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gm8050L7N2E3 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gm8050L7N2E3 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gm8050L7N2E3 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Gm8050L7N2E3 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Gm8050L7N2E3 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Gm8050L7N2E3 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Gm8050L7N2E3 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Gm8050L7N2E3 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Gm8050L7N2E3 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Gm8050L7N2E3 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Gm8050L7N2E3 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Gm8050L7N2E3 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Gm8050L7N2E3 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Gm8050L7N2E3 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Gm8050L7N2E3 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Gm8050L7N2E3 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Gm8050L7N2E3 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Gm8050L7N2E3 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Gm8050L7N2E3 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Gm8050L7N2E3 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Gm8050L7N2E3 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Gm8050L7N2E3 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Gm8050L7N2E3 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Gm8050L7N2E3 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Gm8050L7N2E3 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Gm8050L7N2E3 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Gm8050L7N2E3 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Gm8050L7N2E3 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Gm8050L7N2E3 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Gm8050L7N2E3 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Gm8050L7N2E3 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Gm8050L7N2E3 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Gm8050L7N2E3 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Gm8050L7N2E3 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Gm8050L7N2E3 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Gm8050L7N2E3 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Gm8050L7N2E3 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Gm8050L7N2E3 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Gm8050L7N2E3 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Gm8050L7N2E3 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Gm8050L7N2E3 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Gm8050L7N2E3 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Gm8050L7N2E3 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Gm8050L7N2E3 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Gm8050L7N2E3 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Gm8050L7N2E3 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Gm8050L7N2E3 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Gm8050L7N2E3 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Gm8050L7N2E3 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Gm8050L7N2E3 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Gm8050L7N2E3 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Gm8050L7N2E3 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Gm8050L7N2E3 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Gm8050L7N2E3 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Gm8050L7N2E3 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Gm8050L7N2E3 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Gm8050L7N2E3 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Gm8050L7N2E3 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Gm8050L7N2E3 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Gm8050L7N2E3 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms