Protein–RNA interactions for Protein: L7N2A2

Gm8906, Predicted gene 8906 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8906L7N2A2 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gm8906L7N2A2 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
Gm8906L7N2A2 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gm8906L7N2A2 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gm8906L7N2A2 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gm8906L7N2A2 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gm8906L7N2A2 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gm8906L7N2A2 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gm8906L7N2A2 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gm8906L7N2A2 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gm8906L7N2A2 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gm8906L7N2A2 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gm8906L7N2A2 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gm8906L7N2A2 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gm8906L7N2A2 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Gm8906L7N2A2 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gm8906L7N2A2 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gm8906L7N2A2 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gm8906L7N2A2 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Gm8906L7N2A2 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gm8906L7N2A2 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gm8906L7N2A2 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gm8906L7N2A2 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gm8906L7N2A2 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gm8906L7N2A2 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gm8906L7N2A2 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gm8906L7N2A2 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gm8906L7N2A2 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gm8906L7N2A2 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Gm8906L7N2A2 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gm8906L7N2A2 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gm8906L7N2A2 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gm8906L7N2A2 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gm8906L7N2A2 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gm8906L7N2A2 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gm8906L7N2A2 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gm8906L7N2A2 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gm8906L7N2A2 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gm8906L7N2A2 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gm8906L7N2A2 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gm8906L7N2A2 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gm8906L7N2A2 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gm8906L7N2A2 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gm8906L7N2A2 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gm8906L7N2A2 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gm8906L7N2A2 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gm8906L7N2A2 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gm8906L7N2A2 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gm8906L7N2A2 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gm8906L7N2A2 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gm8906L7N2A2 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Gm8906L7N2A2 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gm8906L7N2A2 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gm8906L7N2A2 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gm8906L7N2A2 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gm8906L7N2A2 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gm8906L7N2A2 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gm8906L7N2A2 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gm8906L7N2A2 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gm8906L7N2A2 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gm8906L7N2A2 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm8906L7N2A2 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm8906L7N2A2 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm8906L7N2A2 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm8906L7N2A2 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm8906L7N2A2 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gm8906L7N2A2 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gm8906L7N2A2 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gm8906L7N2A2 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gm8906L7N2A2 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gm8906L7N2A2 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gm8906L7N2A2 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm8906L7N2A2 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm8906L7N2A2 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm8906L7N2A2 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm8906L7N2A2 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm8906L7N2A2 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm8906L7N2A2 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gm8906L7N2A2 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gm8906L7N2A2 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gm8906L7N2A2 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gm8906L7N2A2 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gm8906L7N2A2 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gm8906L7N2A2 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gm8906L7N2A2 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gm8906L7N2A2 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gm8906L7N2A2 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gm8906L7N2A2 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Gm8906L7N2A2 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gm8906L7N2A2 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm8906L7N2A2 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm8906L7N2A2 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm8906L7N2A2 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm8906L7N2A2 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gm8906L7N2A2 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gm8906L7N2A2 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gm8906L7N2A2 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gm8906L7N2A2 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gm8906L7N2A2 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gm8906L7N2A2 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms