Protein–RNA interactions for Protein: L7N232

Zfp955b, Zinc finger protein 955B, mousemouse

Predictions only

Length 545 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp955bL7N232 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Zfp955bL7N232 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Zfp955bL7N232 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Zfp955bL7N232 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Zfp955bL7N232 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Zfp955bL7N232 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Zfp955bL7N232 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Zfp955bL7N232 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Zfp955bL7N232 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Zfp955bL7N232 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Zfp955bL7N232 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Zfp955bL7N232 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Zfp955bL7N232 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Zfp955bL7N232 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Zfp955bL7N232 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Zfp955bL7N232 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Zfp955bL7N232 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Zfp955bL7N232 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Zfp955bL7N232 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Zfp955bL7N232 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Zfp955bL7N232 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Zfp955bL7N232 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Zfp955bL7N232 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Zfp955bL7N232 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
Zfp955bL7N232 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Zfp955bL7N232 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Zfp955bL7N232 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Zfp955bL7N232 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Zfp955bL7N232 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Zfp955bL7N232 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Zfp955bL7N232 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Zfp955bL7N232 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Zfp955bL7N232 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Zfp955bL7N232 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Zfp955bL7N232 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Zfp955bL7N232 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Zfp955bL7N232 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Zfp955bL7N232 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Zfp955bL7N232 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Zfp955bL7N232 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Zfp955bL7N232 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Zfp955bL7N232 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Zfp955bL7N232 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Zfp955bL7N232 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Zfp955bL7N232 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Zfp955bL7N232 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Zfp955bL7N232 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Zfp955bL7N232 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Zfp955bL7N232 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Zfp955bL7N232 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Zfp955bL7N232 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Zfp955bL7N232 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Zfp955bL7N232 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Zfp955bL7N232 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Zfp955bL7N232 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Zfp955bL7N232 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Zfp955bL7N232 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Zfp955bL7N232 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Zfp955bL7N232 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Zfp955bL7N232 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Zfp955bL7N232 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Zfp955bL7N232 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Zfp955bL7N232 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Zfp955bL7N232 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Zfp955bL7N232 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Zfp955bL7N232 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Zfp955bL7N232 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Zfp955bL7N232 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Zfp955bL7N232 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Zfp955bL7N232 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Zfp955bL7N232 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Zfp955bL7N232 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Zfp955bL7N232 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Zfp955bL7N232 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Zfp955bL7N232 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Zfp955bL7N232 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Zfp955bL7N232 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Zfp955bL7N232 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Zfp955bL7N232 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Zfp955bL7N232 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Zfp955bL7N232 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Zfp955bL7N232 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Zfp955bL7N232 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Zfp955bL7N232 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Zfp955bL7N232 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Zfp955bL7N232 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Zfp955bL7N232 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Zfp955bL7N232 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Zfp955bL7N232 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Zfp955bL7N232 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Zfp955bL7N232 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Zfp955bL7N232 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Zfp955bL7N232 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Zfp955bL7N232 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Zfp955bL7N232 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Zfp955bL7N232 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Zfp955bL7N232 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Zfp955bL7N232 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Zfp955bL7N232 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Zfp955bL7N232 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.7 ms