Protein–RNA interactions for Protein: L7MTU6

Ifnab, Interferon alpha B, mousemouse

Predictions only

Length 190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IfnabL7MTU6 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
IfnabL7MTU6 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
IfnabL7MTU6 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
IfnabL7MTU6 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
IfnabL7MTU6 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
IfnabL7MTU6 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
IfnabL7MTU6 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
IfnabL7MTU6 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
IfnabL7MTU6 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
IfnabL7MTU6 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
IfnabL7MTU6 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
IfnabL7MTU6 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
IfnabL7MTU6 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
IfnabL7MTU6 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
IfnabL7MTU6 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
IfnabL7MTU6 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
IfnabL7MTU6 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
IfnabL7MTU6 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
IfnabL7MTU6 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
IfnabL7MTU6 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
IfnabL7MTU6 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
IfnabL7MTU6 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
IfnabL7MTU6 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
IfnabL7MTU6 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
IfnabL7MTU6 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
IfnabL7MTU6 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
IfnabL7MTU6 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
IfnabL7MTU6 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
IfnabL7MTU6 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
IfnabL7MTU6 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
IfnabL7MTU6 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
IfnabL7MTU6 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
IfnabL7MTU6 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
IfnabL7MTU6 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
IfnabL7MTU6 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
IfnabL7MTU6 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
IfnabL7MTU6 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
IfnabL7MTU6 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
IfnabL7MTU6 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
IfnabL7MTU6 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
IfnabL7MTU6 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
IfnabL7MTU6 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
IfnabL7MTU6 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
IfnabL7MTU6 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
IfnabL7MTU6 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
IfnabL7MTU6 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
IfnabL7MTU6 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
IfnabL7MTU6 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
IfnabL7MTU6 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
IfnabL7MTU6 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
IfnabL7MTU6 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
IfnabL7MTU6 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
IfnabL7MTU6 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
IfnabL7MTU6 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
IfnabL7MTU6 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
IfnabL7MTU6 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
IfnabL7MTU6 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
IfnabL7MTU6 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
IfnabL7MTU6 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
IfnabL7MTU6 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
IfnabL7MTU6 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
IfnabL7MTU6 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
IfnabL7MTU6 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
IfnabL7MTU6 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
IfnabL7MTU6 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
IfnabL7MTU6 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
IfnabL7MTU6 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
IfnabL7MTU6 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
IfnabL7MTU6 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
IfnabL7MTU6 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
IfnabL7MTU6 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
IfnabL7MTU6 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
IfnabL7MTU6 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
IfnabL7MTU6 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
IfnabL7MTU6 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
IfnabL7MTU6 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
IfnabL7MTU6 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
IfnabL7MTU6 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
IfnabL7MTU6 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
IfnabL7MTU6 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
IfnabL7MTU6 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
IfnabL7MTU6 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
IfnabL7MTU6 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
IfnabL7MTU6 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
IfnabL7MTU6 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
IfnabL7MTU6 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
IfnabL7MTU6 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
IfnabL7MTU6 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
IfnabL7MTU6 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
IfnabL7MTU6 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
IfnabL7MTU6 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
IfnabL7MTU6 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
IfnabL7MTU6 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
IfnabL7MTU6 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
IfnabL7MTU6 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
IfnabL7MTU6 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
IfnabL7MTU6 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
IfnabL7MTU6 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
IfnabL7MTU6 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
IfnabL7MTU6 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms