Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ27

Ccdc191, Coiled-coil domain-containing 191, mousemouse

Predictions only

Length 883 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc191J3QQ27 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
Ccdc191J3QQ27 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
Ccdc191J3QQ27 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ccdc191J3QQ27 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ccdc191J3QQ27 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ccdc191J3QQ27 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ccdc191J3QQ27 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ccdc191J3QQ27 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ccdc191J3QQ27 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ccdc191J3QQ27 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ccdc191J3QQ27 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ccdc191J3QQ27 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ccdc191J3QQ27 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ccdc191J3QQ27 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Ccdc191J3QQ27 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Ccdc191J3QQ27 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Ccdc191J3QQ27 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.73
Ccdc191J3QQ27 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ccdc191J3QQ27 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ccdc191J3QQ27 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ccdc191J3QQ27 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ccdc191J3QQ27 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ccdc191J3QQ27 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ccdc191J3QQ27 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ccdc191J3QQ27 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ccdc191J3QQ27 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ccdc191J3QQ27 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ccdc191J3QQ27 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ccdc191J3QQ27 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ccdc191J3QQ27 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ccdc191J3QQ27 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ccdc191J3QQ27 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ccdc191J3QQ27 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ccdc191J3QQ27 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Ccdc191J3QQ27 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Ccdc191J3QQ27 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Ccdc191J3QQ27 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ccdc191J3QQ27 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ccdc191J3QQ27 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ccdc191J3QQ27 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ccdc191J3QQ27 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ccdc191J3QQ27 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ccdc191J3QQ27 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ccdc191J3QQ27 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ccdc191J3QQ27 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ccdc191J3QQ27 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ccdc191J3QQ27 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ccdc191J3QQ27 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ccdc191J3QQ27 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ccdc191J3QQ27 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ccdc191J3QQ27 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ccdc191J3QQ27 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ccdc191J3QQ27 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ccdc191J3QQ27 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ccdc191J3QQ27 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ccdc191J3QQ27 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ccdc191J3QQ27 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ccdc191J3QQ27 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ccdc191J3QQ27 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ccdc191J3QQ27 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ccdc191J3QQ27 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ccdc191J3QQ27 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ccdc191J3QQ27 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ccdc191J3QQ27 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ccdc191J3QQ27 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ccdc191J3QQ27 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ccdc191J3QQ27 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ccdc191J3QQ27 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ccdc191J3QQ27 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ccdc191J3QQ27 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ccdc191J3QQ27 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ccdc191J3QQ27 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Ccdc191J3QQ27 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Ccdc191J3QQ27 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Ccdc191J3QQ27 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ccdc191J3QQ27 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ccdc191J3QQ27 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ccdc191J3QQ27 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
Ccdc191J3QQ27 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ccdc191J3QQ27 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ccdc191J3QQ27 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ccdc191J3QQ27 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ccdc191J3QQ27 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ccdc191J3QQ27 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ccdc191J3QQ27 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ccdc191J3QQ27 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ccdc191J3QQ27 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Ccdc191J3QQ27 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Ccdc191J3QQ27 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
Ccdc191J3QQ27 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ccdc191J3QQ27 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ccdc191J3QQ27 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ccdc191J3QQ27 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ccdc191J3QQ27 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ccdc191J3QQ27 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ccdc191J3QQ27 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ccdc191J3QQ27 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ccdc191J3QQ27 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ccdc191J3QQ27 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ccdc191J3QQ27 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 170.6 ms