Protein–RNA interactions for Protein: J3QPU5

Ccer2, Coiled-coil glutamate-rich protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccer2J3QPU5 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC35.3■■■■□ 3.24
Ccer2J3QPU5 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC35.3■■■■□ 3.24
Ccer2J3QPU5 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
Ccer2J3QPU5 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
Ccer2J3QPU5 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
Ccer2J3QPU5 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC35.27■■■■□ 3.24
Ccer2J3QPU5 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.24
Ccer2J3QPU5 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.26■■■■□ 3.24
Ccer2J3QPU5 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC35.26■■■■□ 3.24
Ccer2J3QPU5 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
Ccer2J3QPU5 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
Ccer2J3QPU5 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC35.24■■■■□ 3.23
Ccer2J3QPU5 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.24■■■■□ 3.23
Ccer2J3QPU5 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
Ccer2J3QPU5 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
Ccer2J3QPU5 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC35.23■■■■□ 3.23
Ccer2J3QPU5 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC35.22■■■■□ 3.23
Ccer2J3QPU5 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
Ccer2J3QPU5 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
Ccer2J3QPU5 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
Ccer2J3QPU5 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
Ccer2J3QPU5 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
Ccer2J3QPU5 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC35.2■■■■□ 3.23
Ccer2J3QPU5 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
Ccer2J3QPU5 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
Ccer2J3QPU5 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
Ccer2J3QPU5 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
Ccer2J3QPU5 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC35.16■■■■□ 3.22
Ccer2J3QPU5 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
Ccer2J3QPU5 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC35.15■■■■□ 3.22
Ccer2J3QPU5 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC35.14■■■■□ 3.22
Ccer2J3QPU5 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
Ccer2J3QPU5 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
Ccer2J3QPU5 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
Ccer2J3QPU5 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
Ccer2J3QPU5 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
Ccer2J3QPU5 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.11■■■■□ 3.21
Ccer2J3QPU5 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
Ccer2J3QPU5 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
Ccer2J3QPU5 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC35.1■■■■□ 3.21
Ccer2J3QPU5 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.1■■■■□ 3.21
Ccer2J3QPU5 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC35.1■■■■□ 3.21
Ccer2J3QPU5 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
Ccer2J3QPU5 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
Ccer2J3QPU5 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
Ccer2J3QPU5 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
Ccer2J3QPU5 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
Ccer2J3QPU5 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC35.08■■■■□ 3.21
Ccer2J3QPU5 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
Ccer2J3QPU5 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC35.06■■■■□ 3.2
Ccer2J3QPU5 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
Ccer2J3QPU5 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC35.06■■■■□ 3.2
Ccer2J3QPU5 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
Ccer2J3QPU5 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
Ccer2J3QPU5 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
Ccer2J3QPU5 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
Ccer2J3QPU5 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC35.04■■■■□ 3.2
Ccer2J3QPU5 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
Ccer2J3QPU5 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
Ccer2J3QPU5 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
Ccer2J3QPU5 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
Ccer2J3QPU5 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
Ccer2J3QPU5 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC35.02■■■■□ 3.2
Ccer2J3QPU5 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
Ccer2J3QPU5 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC35.01■■■■□ 3.2
Ccer2J3QPU5 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.01■■■■□ 3.19
Ccer2J3QPU5 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
Ccer2J3QPU5 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.97■■■■□ 3.19
Ccer2J3QPU5 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
Ccer2J3QPU5 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
Ccer2J3QPU5 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.96■■■■□ 3.19
Ccer2J3QPU5 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC34.96■■■■□ 3.19
Ccer2J3QPU5 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC34.95■■■■□ 3.19
Ccer2J3QPU5 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
Ccer2J3QPU5 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.93■■■■□ 3.18
Ccer2J3QPU5 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
Ccer2J3QPU5 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
Ccer2J3QPU5 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
Ccer2J3QPU5 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
Ccer2J3QPU5 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC34.87■■■■□ 3.17
Ccer2J3QPU5 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
Ccer2J3QPU5 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
Ccer2J3QPU5 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
Ccer2J3QPU5 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
Ccer2J3QPU5 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
Ccer2J3QPU5 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
Ccer2J3QPU5 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
Ccer2J3QPU5 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC34.82■■■■□ 3.16
Ccer2J3QPU5 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC34.79■■■■□ 3.16
Ccer2J3QPU5 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
Ccer2J3QPU5 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
Ccer2J3QPU5 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
Ccer2J3QPU5 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
Ccer2J3QPU5 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
Ccer2J3QPU5 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
Ccer2J3QPU5 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.16
Ccer2J3QPU5 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC34.76■■■■□ 3.16
Ccer2J3QPU5 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC34.76■■■■□ 3.16
Ccer2J3QPU5 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.76■■■■□ 3.15
Ccer2J3QPU5 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC34.75■■■■□ 3.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.1 ms