Protein–RNA interactions for Protein: J3QMW5

Gm2075, Predicted gene 2075, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2075J3QMW5 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Gm2075J3QMW5 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gm2075J3QMW5 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gm2075J3QMW5 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Gm2075J3QMW5 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gm2075J3QMW5 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm2075J3QMW5 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm2075J3QMW5 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm2075J3QMW5 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm2075J3QMW5 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gm2075J3QMW5 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gm2075J3QMW5 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gm2075J3QMW5 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm2075J3QMW5 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm2075J3QMW5 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm2075J3QMW5 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm2075J3QMW5 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gm2075J3QMW5 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gm2075J3QMW5 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gm2075J3QMW5 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gm2075J3QMW5 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gm2075J3QMW5 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gm2075J3QMW5 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gm2075J3QMW5 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gm2075J3QMW5 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gm2075J3QMW5 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gm2075J3QMW5 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gm2075J3QMW5 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gm2075J3QMW5 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gm2075J3QMW5 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm2075J3QMW5 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gm2075J3QMW5 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gm2075J3QMW5 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gm2075J3QMW5 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gm2075J3QMW5 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gm2075J3QMW5 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gm2075J3QMW5 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gm2075J3QMW5 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gm2075J3QMW5 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gm2075J3QMW5 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gm2075J3QMW5 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gm2075J3QMW5 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gm2075J3QMW5 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Gm2075J3QMW5 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Gm2075J3QMW5 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gm2075J3QMW5 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Gm2075J3QMW5 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Gm2075J3QMW5 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gm2075J3QMW5 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Gm2075J3QMW5 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gm2075J3QMW5 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gm2075J3QMW5 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gm2075J3QMW5 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gm2075J3QMW5 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Gm2075J3QMW5 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gm2075J3QMW5 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gm2075J3QMW5 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gm2075J3QMW5 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Gm2075J3QMW5 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Gm2075J3QMW5 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gm2075J3QMW5 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Gm2075J3QMW5 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gm2075J3QMW5 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gm2075J3QMW5 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gm2075J3QMW5 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gm2075J3QMW5 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gm2075J3QMW5 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gm2075J3QMW5 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gm2075J3QMW5 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gm2075J3QMW5 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gm2075J3QMW5 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gm2075J3QMW5 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gm2075J3QMW5 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gm2075J3QMW5 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gm2075J3QMW5 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gm2075J3QMW5 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gm2075J3QMW5 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.99
Gm2075J3QMW5 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gm2075J3QMW5 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gm2075J3QMW5 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gm2075J3QMW5 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gm2075J3QMW5 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gm2075J3QMW5 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gm2075J3QMW5 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gm2075J3QMW5 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gm2075J3QMW5 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gm2075J3QMW5 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gm2075J3QMW5 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gm2075J3QMW5 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gm2075J3QMW5 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gm2075J3QMW5 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gm2075J3QMW5 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gm2075J3QMW5 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gm2075J3QMW5 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Gm2075J3QMW5 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gm2075J3QMW5 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gm2075J3QMW5 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Gm2075J3QMW5 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gm2075J3QMW5 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gm2075J3QMW5 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 131.7 ms