Protein–RNA interactions for Protein: J3QMS2

1700014D04Rik, MCG148436, mousemouse

Predictions only

Length 983 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700014D04RikJ3QMS2 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
1700014D04RikJ3QMS2 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
1700014D04RikJ3QMS2 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
1700014D04RikJ3QMS2 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
1700014D04RikJ3QMS2 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
1700014D04RikJ3QMS2 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
1700014D04RikJ3QMS2 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
1700014D04RikJ3QMS2 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
1700014D04RikJ3QMS2 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
1700014D04RikJ3QMS2 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
1700014D04RikJ3QMS2 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
1700014D04RikJ3QMS2 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
1700014D04RikJ3QMS2 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
1700014D04RikJ3QMS2 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
1700014D04RikJ3QMS2 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
1700014D04RikJ3QMS2 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
1700014D04RikJ3QMS2 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
1700014D04RikJ3QMS2 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
1700014D04RikJ3QMS2 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
1700014D04RikJ3QMS2 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
1700014D04RikJ3QMS2 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
1700014D04RikJ3QMS2 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
1700014D04RikJ3QMS2 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
1700014D04RikJ3QMS2 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
1700014D04RikJ3QMS2 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
1700014D04RikJ3QMS2 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
1700014D04RikJ3QMS2 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
1700014D04RikJ3QMS2 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
1700014D04RikJ3QMS2 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
1700014D04RikJ3QMS2 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
1700014D04RikJ3QMS2 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
1700014D04RikJ3QMS2 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
1700014D04RikJ3QMS2 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
1700014D04RikJ3QMS2 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
1700014D04RikJ3QMS2 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
1700014D04RikJ3QMS2 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
1700014D04RikJ3QMS2 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
1700014D04RikJ3QMS2 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
1700014D04RikJ3QMS2 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
1700014D04RikJ3QMS2 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
1700014D04RikJ3QMS2 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
1700014D04RikJ3QMS2 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
1700014D04RikJ3QMS2 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
1700014D04RikJ3QMS2 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
1700014D04RikJ3QMS2 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
1700014D04RikJ3QMS2 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
1700014D04RikJ3QMS2 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
1700014D04RikJ3QMS2 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
1700014D04RikJ3QMS2 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
1700014D04RikJ3QMS2 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
1700014D04RikJ3QMS2 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
1700014D04RikJ3QMS2 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
1700014D04RikJ3QMS2 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
1700014D04RikJ3QMS2 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
1700014D04RikJ3QMS2 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
1700014D04RikJ3QMS2 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
1700014D04RikJ3QMS2 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
1700014D04RikJ3QMS2 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
1700014D04RikJ3QMS2 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
1700014D04RikJ3QMS2 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
1700014D04RikJ3QMS2 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
1700014D04RikJ3QMS2 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
1700014D04RikJ3QMS2 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
1700014D04RikJ3QMS2 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
1700014D04RikJ3QMS2 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
1700014D04RikJ3QMS2 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
1700014D04RikJ3QMS2 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
1700014D04RikJ3QMS2 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
1700014D04RikJ3QMS2 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
1700014D04RikJ3QMS2 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
1700014D04RikJ3QMS2 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
1700014D04RikJ3QMS2 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
1700014D04RikJ3QMS2 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
1700014D04RikJ3QMS2 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
1700014D04RikJ3QMS2 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
1700014D04RikJ3QMS2 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
1700014D04RikJ3QMS2 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
1700014D04RikJ3QMS2 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
1700014D04RikJ3QMS2 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
1700014D04RikJ3QMS2 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
1700014D04RikJ3QMS2 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
1700014D04RikJ3QMS2 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
1700014D04RikJ3QMS2 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
1700014D04RikJ3QMS2 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
1700014D04RikJ3QMS2 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
1700014D04RikJ3QMS2 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
1700014D04RikJ3QMS2 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
1700014D04RikJ3QMS2 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
1700014D04RikJ3QMS2 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
1700014D04RikJ3QMS2 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
1700014D04RikJ3QMS2 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
1700014D04RikJ3QMS2 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
1700014D04RikJ3QMS2 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
1700014D04RikJ3QMS2 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
1700014D04RikJ3QMS2 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
1700014D04RikJ3QMS2 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
1700014D04RikJ3QMS2 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
1700014D04RikJ3QMS2 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
1700014D04RikJ3QMS2 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
1700014D04RikJ3QMS2 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77 ms