Protein–RNA interactions for Protein: J3QK56

4930544D05Rik, RIKEN cDNA 4930544D05 gene, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930544D05RikJ3QK56 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
4930544D05RikJ3QK56 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
4930544D05RikJ3QK56 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
4930544D05RikJ3QK56 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
4930544D05RikJ3QK56 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
4930544D05RikJ3QK56 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
4930544D05RikJ3QK56 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
4930544D05RikJ3QK56 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
4930544D05RikJ3QK56 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
4930544D05RikJ3QK56 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
4930544D05RikJ3QK56 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
4930544D05RikJ3QK56 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
4930544D05RikJ3QK56 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
4930544D05RikJ3QK56 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
4930544D05RikJ3QK56 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
4930544D05RikJ3QK56 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
4930544D05RikJ3QK56 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
4930544D05RikJ3QK56 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
4930544D05RikJ3QK56 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
4930544D05RikJ3QK56 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
4930544D05RikJ3QK56 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
4930544D05RikJ3QK56 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
4930544D05RikJ3QK56 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
4930544D05RikJ3QK56 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
4930544D05RikJ3QK56 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
4930544D05RikJ3QK56 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
4930544D05RikJ3QK56 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
4930544D05RikJ3QK56 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
4930544D05RikJ3QK56 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
4930544D05RikJ3QK56 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
4930544D05RikJ3QK56 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
4930544D05RikJ3QK56 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
4930544D05RikJ3QK56 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
4930544D05RikJ3QK56 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
4930544D05RikJ3QK56 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
4930544D05RikJ3QK56 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
4930544D05RikJ3QK56 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
4930544D05RikJ3QK56 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
4930544D05RikJ3QK56 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
4930544D05RikJ3QK56 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
4930544D05RikJ3QK56 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
4930544D05RikJ3QK56 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
4930544D05RikJ3QK56 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
4930544D05RikJ3QK56 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
4930544D05RikJ3QK56 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
4930544D05RikJ3QK56 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
4930544D05RikJ3QK56 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
4930544D05RikJ3QK56 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
4930544D05RikJ3QK56 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
4930544D05RikJ3QK56 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
4930544D05RikJ3QK56 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
4930544D05RikJ3QK56 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
4930544D05RikJ3QK56 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
4930544D05RikJ3QK56 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
4930544D05RikJ3QK56 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
4930544D05RikJ3QK56 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
4930544D05RikJ3QK56 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
4930544D05RikJ3QK56 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
4930544D05RikJ3QK56 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
4930544D05RikJ3QK56 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
4930544D05RikJ3QK56 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
4930544D05RikJ3QK56 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
4930544D05RikJ3QK56 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
4930544D05RikJ3QK56 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
4930544D05RikJ3QK56 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
4930544D05RikJ3QK56 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
4930544D05RikJ3QK56 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
4930544D05RikJ3QK56 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
4930544D05RikJ3QK56 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
4930544D05RikJ3QK56 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
4930544D05RikJ3QK56 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
4930544D05RikJ3QK56 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
4930544D05RikJ3QK56 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
4930544D05RikJ3QK56 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
4930544D05RikJ3QK56 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
4930544D05RikJ3QK56 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
4930544D05RikJ3QK56 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
4930544D05RikJ3QK56 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
4930544D05RikJ3QK56 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
4930544D05RikJ3QK56 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
4930544D05RikJ3QK56 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
4930544D05RikJ3QK56 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
4930544D05RikJ3QK56 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
4930544D05RikJ3QK56 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
4930544D05RikJ3QK56 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
4930544D05RikJ3QK56 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
4930544D05RikJ3QK56 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
4930544D05RikJ3QK56 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
4930544D05RikJ3QK56 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
4930544D05RikJ3QK56 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
4930544D05RikJ3QK56 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
4930544D05RikJ3QK56 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
4930544D05RikJ3QK56 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
4930544D05RikJ3QK56 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
4930544D05RikJ3QK56 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
4930544D05RikJ3QK56 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
4930544D05RikJ3QK56 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
4930544D05RikJ3QK56 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
4930544D05RikJ3QK56 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
4930544D05RikJ3QK56 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms