Protein–RNA interactions for Protein: H7BX60

Pot1b, Protection of telomeres 1B, mousemouse

Predictions only

Length 640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pot1bH7BX60 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pot1bH7BX60 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pot1bH7BX60 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pot1bH7BX60 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pot1bH7BX60 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Pot1bH7BX60 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Pot1bH7BX60 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pot1bH7BX60 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pot1bH7BX60 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pot1bH7BX60 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pot1bH7BX60 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Pot1bH7BX60 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pot1bH7BX60 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pot1bH7BX60 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Pot1bH7BX60 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pot1bH7BX60 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pot1bH7BX60 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Pot1bH7BX60 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Pot1bH7BX60 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Pot1bH7BX60 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Pot1bH7BX60 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Pot1bH7BX60 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pot1bH7BX60 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pot1bH7BX60 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pot1bH7BX60 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pot1bH7BX60 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pot1bH7BX60 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pot1bH7BX60 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pot1bH7BX60 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pot1bH7BX60 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pot1bH7BX60 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Pot1bH7BX60 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Pot1bH7BX60 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pot1bH7BX60 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pot1bH7BX60 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pot1bH7BX60 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pot1bH7BX60 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pot1bH7BX60 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Pot1bH7BX60 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Pot1bH7BX60 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Pot1bH7BX60 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Pot1bH7BX60 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Pot1bH7BX60 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Pot1bH7BX60 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Pot1bH7BX60 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Pot1bH7BX60 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Pot1bH7BX60 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Pot1bH7BX60 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pot1bH7BX60 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pot1bH7BX60 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Pot1bH7BX60 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Pot1bH7BX60 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Pot1bH7BX60 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Pot1bH7BX60 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Pot1bH7BX60 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Pot1bH7BX60 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Pot1bH7BX60 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Pot1bH7BX60 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Pot1bH7BX60 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pot1bH7BX60 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pot1bH7BX60 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pot1bH7BX60 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pot1bH7BX60 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Pot1bH7BX60 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Pot1bH7BX60 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Pot1bH7BX60 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pot1bH7BX60 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pot1bH7BX60 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pot1bH7BX60 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pot1bH7BX60 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pot1bH7BX60 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pot1bH7BX60 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pot1bH7BX60 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pot1bH7BX60 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pot1bH7BX60 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pot1bH7BX60 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pot1bH7BX60 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pot1bH7BX60 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pot1bH7BX60 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pot1bH7BX60 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pot1bH7BX60 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pot1bH7BX60 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Pot1bH7BX60 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Pot1bH7BX60 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Pot1bH7BX60 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Pot1bH7BX60 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pot1bH7BX60 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pot1bH7BX60 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pot1bH7BX60 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pot1bH7BX60 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pot1bH7BX60 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Pot1bH7BX60 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pot1bH7BX60 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pot1bH7BX60 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pot1bH7BX60 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pot1bH7BX60 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pot1bH7BX60 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pot1bH7BX60 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pot1bH7BX60 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Pot1bH7BX60 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.4 ms