Protein–RNA interactions for Protein: G5E8K1

2610028H24Rik, RIKEN cDNA 2610028H24, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
2610028H24RikG5E8K1 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
2610028H24RikG5E8K1 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
2610028H24RikG5E8K1 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
2610028H24RikG5E8K1 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
2610028H24RikG5E8K1 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
2610028H24RikG5E8K1 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
2610028H24RikG5E8K1 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
2610028H24RikG5E8K1 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
2610028H24RikG5E8K1 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
2610028H24RikG5E8K1 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
2610028H24RikG5E8K1 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
2610028H24RikG5E8K1 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
2610028H24RikG5E8K1 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
2610028H24RikG5E8K1 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
2610028H24RikG5E8K1 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
2610028H24RikG5E8K1 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
2610028H24RikG5E8K1 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
2610028H24RikG5E8K1 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
2610028H24RikG5E8K1 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
2610028H24RikG5E8K1 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
2610028H24RikG5E8K1 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
2610028H24RikG5E8K1 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
2610028H24RikG5E8K1 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
2610028H24RikG5E8K1 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
2610028H24RikG5E8K1 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
2610028H24RikG5E8K1 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
2610028H24RikG5E8K1 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
2610028H24RikG5E8K1 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
2610028H24RikG5E8K1 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
2610028H24RikG5E8K1 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
2610028H24RikG5E8K1 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
2610028H24RikG5E8K1 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
2610028H24RikG5E8K1 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
2610028H24RikG5E8K1 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
2610028H24RikG5E8K1 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
2610028H24RikG5E8K1 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
2610028H24RikG5E8K1 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
2610028H24RikG5E8K1 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
2610028H24RikG5E8K1 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
2610028H24RikG5E8K1 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
2610028H24RikG5E8K1 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
2610028H24RikG5E8K1 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
2610028H24RikG5E8K1 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
2610028H24RikG5E8K1 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
2610028H24RikG5E8K1 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
2610028H24RikG5E8K1 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
2610028H24RikG5E8K1 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
2610028H24RikG5E8K1 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
2610028H24RikG5E8K1 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
2610028H24RikG5E8K1 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
2610028H24RikG5E8K1 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
2610028H24RikG5E8K1 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
2610028H24RikG5E8K1 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
2610028H24RikG5E8K1 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
2610028H24RikG5E8K1 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
2610028H24RikG5E8K1 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
2610028H24RikG5E8K1 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
2610028H24RikG5E8K1 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
2610028H24RikG5E8K1 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
2610028H24RikG5E8K1 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
2610028H24RikG5E8K1 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
2610028H24RikG5E8K1 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
2610028H24RikG5E8K1 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
2610028H24RikG5E8K1 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
2610028H24RikG5E8K1 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
2610028H24RikG5E8K1 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
2610028H24RikG5E8K1 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
2610028H24RikG5E8K1 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
2610028H24RikG5E8K1 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
2610028H24RikG5E8K1 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
2610028H24RikG5E8K1 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
2610028H24RikG5E8K1 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
2610028H24RikG5E8K1 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
2610028H24RikG5E8K1 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
2610028H24RikG5E8K1 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
2610028H24RikG5E8K1 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
2610028H24RikG5E8K1 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
2610028H24RikG5E8K1 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
2610028H24RikG5E8K1 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
2610028H24RikG5E8K1 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
2610028H24RikG5E8K1 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
2610028H24RikG5E8K1 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
2610028H24RikG5E8K1 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
2610028H24RikG5E8K1 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
2610028H24RikG5E8K1 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
2610028H24RikG5E8K1 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
2610028H24RikG5E8K1 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
2610028H24RikG5E8K1 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
2610028H24RikG5E8K1 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
2610028H24RikG5E8K1 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
2610028H24RikG5E8K1 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
2610028H24RikG5E8K1 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
2610028H24RikG5E8K1 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
2610028H24RikG5E8K1 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
2610028H24RikG5E8K1 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
2610028H24RikG5E8K1 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
2610028H24RikG5E8K1 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
2610028H24RikG5E8K1 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
2610028H24RikG5E8K1 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
2610028H24RikG5E8K1 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.4 ms