Protein–RNA interactions for Protein: G3X939

Slc9a3, Sodium/hydrogen exchanger 3, mousemouse

Predictions only

Length 829 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc9a3G3X939 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Slc9a3G3X939 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Slc9a3G3X939 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Slc9a3G3X939 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Slc9a3G3X939 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Slc9a3G3X939 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Slc9a3G3X939 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Slc9a3G3X939 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Slc9a3G3X939 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Slc9a3G3X939 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Slc9a3G3X939 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Slc9a3G3X939 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Slc9a3G3X939 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Slc9a3G3X939 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Slc9a3G3X939 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Slc9a3G3X939 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Slc9a3G3X939 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Slc9a3G3X939 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Slc9a3G3X939 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Slc9a3G3X939 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Slc9a3G3X939 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Slc9a3G3X939 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Slc9a3G3X939 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Slc9a3G3X939 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Slc9a3G3X939 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Slc9a3G3X939 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Slc9a3G3X939 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Slc9a3G3X939 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Slc9a3G3X939 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Slc9a3G3X939 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Slc9a3G3X939 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Slc9a3G3X939 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Slc9a3G3X939 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Slc9a3G3X939 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Slc9a3G3X939 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Slc9a3G3X939 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Slc9a3G3X939 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Slc9a3G3X939 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Slc9a3G3X939 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Slc9a3G3X939 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Slc9a3G3X939 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Slc9a3G3X939 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Slc9a3G3X939 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Slc9a3G3X939 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Slc9a3G3X939 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Slc9a3G3X939 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Slc9a3G3X939 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Slc9a3G3X939 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Slc9a3G3X939 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Slc9a3G3X939 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Slc9a3G3X939 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Slc9a3G3X939 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Slc9a3G3X939 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Slc9a3G3X939 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Slc9a3G3X939 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Slc9a3G3X939 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Slc9a3G3X939 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Slc9a3G3X939 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Slc9a3G3X939 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Slc9a3G3X939 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Slc9a3G3X939 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Slc9a3G3X939 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Slc9a3G3X939 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Slc9a3G3X939 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Slc9a3G3X939 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Slc9a3G3X939 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Slc9a3G3X939 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Slc9a3G3X939 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Slc9a3G3X939 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Slc9a3G3X939 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Slc9a3G3X939 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Slc9a3G3X939 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Slc9a3G3X939 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Slc9a3G3X939 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Slc9a3G3X939 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Slc9a3G3X939 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Slc9a3G3X939 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Slc9a3G3X939 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Slc9a3G3X939 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Slc9a3G3X939 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Slc9a3G3X939 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Slc9a3G3X939 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Slc9a3G3X939 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Slc9a3G3X939 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Slc9a3G3X939 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Slc9a3G3X939 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Slc9a3G3X939 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Slc9a3G3X939 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Slc9a3G3X939 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Slc9a3G3X939 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Slc9a3G3X939 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Slc9a3G3X939 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Slc9a3G3X939 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Slc9a3G3X939 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Slc9a3G3X939 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Slc9a3G3X939 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Slc9a3G3X939 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Slc9a3G3X939 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Slc9a3G3X939 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Slc9a3G3X939 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms