Protein–RNA interactions for Protein: F8VPU2

Farp1, FERM, ARHGEF and pleckstrin domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,048 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Farp1F8VPU2 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Farp1F8VPU2 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Farp1F8VPU2 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Farp1F8VPU2 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Farp1F8VPU2 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Farp1F8VPU2 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Farp1F8VPU2 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Farp1F8VPU2 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Farp1F8VPU2 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Farp1F8VPU2 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Farp1F8VPU2 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Farp1F8VPU2 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Farp1F8VPU2 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Farp1F8VPU2 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Farp1F8VPU2 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Farp1F8VPU2 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Farp1F8VPU2 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Farp1F8VPU2 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Farp1F8VPU2 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Farp1F8VPU2 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Farp1F8VPU2 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Farp1F8VPU2 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Farp1F8VPU2 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Farp1F8VPU2 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Farp1F8VPU2 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Farp1F8VPU2 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Farp1F8VPU2 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Farp1F8VPU2 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Farp1F8VPU2 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Farp1F8VPU2 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Farp1F8VPU2 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Farp1F8VPU2 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Farp1F8VPU2 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Farp1F8VPU2 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Farp1F8VPU2 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Farp1F8VPU2 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Farp1F8VPU2 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Farp1F8VPU2 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Farp1F8VPU2 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Farp1F8VPU2 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Farp1F8VPU2 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Farp1F8VPU2 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Farp1F8VPU2 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Farp1F8VPU2 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Farp1F8VPU2 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Farp1F8VPU2 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Farp1F8VPU2 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Farp1F8VPU2 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Farp1F8VPU2 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Farp1F8VPU2 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Farp1F8VPU2 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Farp1F8VPU2 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Farp1F8VPU2 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Farp1F8VPU2 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Farp1F8VPU2 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Farp1F8VPU2 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Farp1F8VPU2 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Farp1F8VPU2 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Farp1F8VPU2 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Farp1F8VPU2 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Farp1F8VPU2 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Farp1F8VPU2 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Farp1F8VPU2 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Farp1F8VPU2 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Farp1F8VPU2 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Farp1F8VPU2 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Farp1F8VPU2 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Farp1F8VPU2 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Farp1F8VPU2 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Farp1F8VPU2 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Farp1F8VPU2 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Farp1F8VPU2 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Farp1F8VPU2 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Farp1F8VPU2 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Farp1F8VPU2 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Farp1F8VPU2 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Farp1F8VPU2 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Farp1F8VPU2 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Farp1F8VPU2 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Farp1F8VPU2 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Farp1F8VPU2 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Farp1F8VPU2 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Farp1F8VPU2 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Farp1F8VPU2 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
Farp1F8VPU2 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Farp1F8VPU2 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Farp1F8VPU2 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Farp1F8VPU2 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Farp1F8VPU2 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Farp1F8VPU2 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Farp1F8VPU2 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Farp1F8VPU2 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Farp1F8VPU2 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Farp1F8VPU2 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Farp1F8VPU2 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Farp1F8VPU2 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Farp1F8VPU2 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Farp1F8VPU2 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Farp1F8VPU2 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Farp1F8VPU2 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.3 ms