Protein–RNA interactions for Protein: F6VRN1

Smgc, Submandibular gland protein C (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SmgcF6VRN1 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SmgcF6VRN1 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SmgcF6VRN1 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SmgcF6VRN1 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SmgcF6VRN1 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
SmgcF6VRN1 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
SmgcF6VRN1 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SmgcF6VRN1 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SmgcF6VRN1 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SmgcF6VRN1 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SmgcF6VRN1 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SmgcF6VRN1 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SmgcF6VRN1 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SmgcF6VRN1 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SmgcF6VRN1 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SmgcF6VRN1 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SmgcF6VRN1 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SmgcF6VRN1 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SmgcF6VRN1 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SmgcF6VRN1 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SmgcF6VRN1 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
SmgcF6VRN1 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SmgcF6VRN1 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SmgcF6VRN1 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SmgcF6VRN1 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SmgcF6VRN1 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SmgcF6VRN1 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SmgcF6VRN1 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
SmgcF6VRN1 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SmgcF6VRN1 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SmgcF6VRN1 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
SmgcF6VRN1 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SmgcF6VRN1 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SmgcF6VRN1 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
SmgcF6VRN1 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SmgcF6VRN1 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SmgcF6VRN1 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SmgcF6VRN1 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SmgcF6VRN1 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SmgcF6VRN1 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SmgcF6VRN1 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SmgcF6VRN1 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SmgcF6VRN1 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SmgcF6VRN1 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SmgcF6VRN1 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SmgcF6VRN1 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SmgcF6VRN1 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SmgcF6VRN1 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SmgcF6VRN1 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SmgcF6VRN1 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SmgcF6VRN1 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SmgcF6VRN1 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SmgcF6VRN1 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
SmgcF6VRN1 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SmgcF6VRN1 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SmgcF6VRN1 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SmgcF6VRN1 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SmgcF6VRN1 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SmgcF6VRN1 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SmgcF6VRN1 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SmgcF6VRN1 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SmgcF6VRN1 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SmgcF6VRN1 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SmgcF6VRN1 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SmgcF6VRN1 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SmgcF6VRN1 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
SmgcF6VRN1 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SmgcF6VRN1 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SmgcF6VRN1 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SmgcF6VRN1 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SmgcF6VRN1 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SmgcF6VRN1 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SmgcF6VRN1 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SmgcF6VRN1 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SmgcF6VRN1 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SmgcF6VRN1 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SmgcF6VRN1 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SmgcF6VRN1 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SmgcF6VRN1 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SmgcF6VRN1 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SmgcF6VRN1 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SmgcF6VRN1 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SmgcF6VRN1 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
SmgcF6VRN1 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SmgcF6VRN1 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SmgcF6VRN1 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SmgcF6VRN1 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SmgcF6VRN1 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SmgcF6VRN1 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SmgcF6VRN1 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SmgcF6VRN1 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SmgcF6VRN1 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SmgcF6VRN1 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SmgcF6VRN1 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
SmgcF6VRN1 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SmgcF6VRN1 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SmgcF6VRN1 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SmgcF6VRN1 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SmgcF6VRN1 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SmgcF6VRN1 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms