Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9U2

Speer2, Spermatogenesis-associated glutamate (E)-rich protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Speer2E9Q9U2 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Speer2E9Q9U2 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Speer2E9Q9U2 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Speer2E9Q9U2 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Speer2E9Q9U2 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Speer2E9Q9U2 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Speer2E9Q9U2 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Speer2E9Q9U2 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Speer2E9Q9U2 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Speer2E9Q9U2 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Speer2E9Q9U2 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Speer2E9Q9U2 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Speer2E9Q9U2 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Speer2E9Q9U2 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Speer2E9Q9U2 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Speer2E9Q9U2 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Speer2E9Q9U2 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Speer2E9Q9U2 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Speer2E9Q9U2 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Speer2E9Q9U2 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Speer2E9Q9U2 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Speer2E9Q9U2 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Speer2E9Q9U2 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Speer2E9Q9U2 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Speer2E9Q9U2 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Speer2E9Q9U2 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Speer2E9Q9U2 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Speer2E9Q9U2 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Speer2E9Q9U2 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Speer2E9Q9U2 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Speer2E9Q9U2 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Speer2E9Q9U2 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Speer2E9Q9U2 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Speer2E9Q9U2 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Speer2E9Q9U2 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Speer2E9Q9U2 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Speer2E9Q9U2 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Speer2E9Q9U2 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Speer2E9Q9U2 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Speer2E9Q9U2 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Speer2E9Q9U2 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Speer2E9Q9U2 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Speer2E9Q9U2 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Speer2E9Q9U2 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Speer2E9Q9U2 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Speer2E9Q9U2 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Speer2E9Q9U2 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Speer2E9Q9U2 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Speer2E9Q9U2 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Speer2E9Q9U2 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Speer2E9Q9U2 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Speer2E9Q9U2 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Speer2E9Q9U2 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Speer2E9Q9U2 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Speer2E9Q9U2 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Speer2E9Q9U2 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Speer2E9Q9U2 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Speer2E9Q9U2 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Speer2E9Q9U2 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Speer2E9Q9U2 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Speer2E9Q9U2 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Speer2E9Q9U2 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Speer2E9Q9U2 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Speer2E9Q9U2 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Speer2E9Q9U2 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Speer2E9Q9U2 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Speer2E9Q9U2 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Speer2E9Q9U2 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Speer2E9Q9U2 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Speer2E9Q9U2 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Speer2E9Q9U2 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Speer2E9Q9U2 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Speer2E9Q9U2 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Speer2E9Q9U2 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Speer2E9Q9U2 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Speer2E9Q9U2 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Speer2E9Q9U2 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Speer2E9Q9U2 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Speer2E9Q9U2 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Speer2E9Q9U2 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Speer2E9Q9U2 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Speer2E9Q9U2 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Speer2E9Q9U2 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Speer2E9Q9U2 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Speer2E9Q9U2 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Speer2E9Q9U2 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Speer2E9Q9U2 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Speer2E9Q9U2 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Speer2E9Q9U2 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Speer2E9Q9U2 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Speer2E9Q9U2 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Speer2E9Q9U2 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Speer2E9Q9U2 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Speer2E9Q9U2 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Speer2E9Q9U2 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Speer2E9Q9U2 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Speer2E9Q9U2 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Speer2E9Q9U2 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Speer2E9Q9U2 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Speer2E9Q9U2 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.6 ms