Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9F6

Catsperd, Cation channel sperm-associated protein subunit delta, mousemouse

Predictions only

Length 805 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CatsperdE9Q9F6 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CatsperdE9Q9F6 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CatsperdE9Q9F6 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CatsperdE9Q9F6 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CatsperdE9Q9F6 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CatsperdE9Q9F6 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CatsperdE9Q9F6 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CatsperdE9Q9F6 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CatsperdE9Q9F6 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CatsperdE9Q9F6 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CatsperdE9Q9F6 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
CatsperdE9Q9F6 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CatsperdE9Q9F6 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CatsperdE9Q9F6 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CatsperdE9Q9F6 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CatsperdE9Q9F6 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
CatsperdE9Q9F6 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CatsperdE9Q9F6 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CatsperdE9Q9F6 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CatsperdE9Q9F6 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
CatsperdE9Q9F6 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CatsperdE9Q9F6 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CatsperdE9Q9F6 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CatsperdE9Q9F6 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CatsperdE9Q9F6 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CatsperdE9Q9F6 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
CatsperdE9Q9F6 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
CatsperdE9Q9F6 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CatsperdE9Q9F6 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CatsperdE9Q9F6 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CatsperdE9Q9F6 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CatsperdE9Q9F6 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CatsperdE9Q9F6 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CatsperdE9Q9F6 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CatsperdE9Q9F6 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CatsperdE9Q9F6 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CatsperdE9Q9F6 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CatsperdE9Q9F6 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CatsperdE9Q9F6 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CatsperdE9Q9F6 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CatsperdE9Q9F6 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CatsperdE9Q9F6 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CatsperdE9Q9F6 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CatsperdE9Q9F6 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CatsperdE9Q9F6 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
CatsperdE9Q9F6 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CatsperdE9Q9F6 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CatsperdE9Q9F6 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CatsperdE9Q9F6 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CatsperdE9Q9F6 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CatsperdE9Q9F6 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CatsperdE9Q9F6 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CatsperdE9Q9F6 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
CatsperdE9Q9F6 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CatsperdE9Q9F6 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CatsperdE9Q9F6 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CatsperdE9Q9F6 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CatsperdE9Q9F6 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
CatsperdE9Q9F6 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CatsperdE9Q9F6 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CatsperdE9Q9F6 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CatsperdE9Q9F6 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CatsperdE9Q9F6 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CatsperdE9Q9F6 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
CatsperdE9Q9F6 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CatsperdE9Q9F6 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CatsperdE9Q9F6 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CatsperdE9Q9F6 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CatsperdE9Q9F6 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CatsperdE9Q9F6 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CatsperdE9Q9F6 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CatsperdE9Q9F6 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CatsperdE9Q9F6 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CatsperdE9Q9F6 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CatsperdE9Q9F6 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CatsperdE9Q9F6 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CatsperdE9Q9F6 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CatsperdE9Q9F6 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CatsperdE9Q9F6 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CatsperdE9Q9F6 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CatsperdE9Q9F6 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CatsperdE9Q9F6 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CatsperdE9Q9F6 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CatsperdE9Q9F6 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CatsperdE9Q9F6 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CatsperdE9Q9F6 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CatsperdE9Q9F6 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CatsperdE9Q9F6 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CatsperdE9Q9F6 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CatsperdE9Q9F6 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CatsperdE9Q9F6 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CatsperdE9Q9F6 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CatsperdE9Q9F6 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CatsperdE9Q9F6 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CatsperdE9Q9F6 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CatsperdE9Q9F6 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CatsperdE9Q9F6 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CatsperdE9Q9F6 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CatsperdE9Q9F6 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CatsperdE9Q9F6 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.7 ms