Protein–RNA interactions for Protein: E9Q5C9

Nolc1, Nucleolar and coiled-body phosphoprotein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 702 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nolc1E9Q5C9 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Nolc1E9Q5C9 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC30.38■■■□□ 2.45
Nolc1E9Q5C9 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
Nolc1E9Q5C9 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
Nolc1E9Q5C9 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
Nolc1E9Q5C9 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
Nolc1E9Q5C9 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.35■■■□□ 2.45
Nolc1E9Q5C9 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
Nolc1E9Q5C9 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
Nolc1E9Q5C9 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
Nolc1E9Q5C9 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
Nolc1E9Q5C9 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC30.32■■■□□ 2.44
Nolc1E9Q5C9 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC30.31■■■□□ 2.44
Nolc1E9Q5C9 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Nolc1E9Q5C9 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC30.3■■■□□ 2.44
Nolc1E9Q5C9 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC30.3■■■□□ 2.44
Nolc1E9Q5C9 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC30.3■■■□□ 2.44
Nolc1E9Q5C9 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
Nolc1E9Q5C9 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
Nolc1E9Q5C9 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
Nolc1E9Q5C9 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
Nolc1E9Q5C9 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.29■■■□□ 2.44
Nolc1E9Q5C9 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.29■■■□□ 2.44
Nolc1E9Q5C9 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC30.29■■■□□ 2.44
Nolc1E9Q5C9 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC30.29■■■□□ 2.44
Nolc1E9Q5C9 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
Nolc1E9Q5C9 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
Nolc1E9Q5C9 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
Nolc1E9Q5C9 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Nolc1E9Q5C9 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Nolc1E9Q5C9 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Nolc1E9Q5C9 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
Nolc1E9Q5C9 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Nolc1E9Q5C9 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC30.24■■■□□ 2.43
Nolc1E9Q5C9 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
Nolc1E9Q5C9 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Nolc1E9Q5C9 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Nolc1E9Q5C9 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
Nolc1E9Q5C9 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
Nolc1E9Q5C9 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
Nolc1E9Q5C9 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Nolc1E9Q5C9 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
Nolc1E9Q5C9 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Nolc1E9Q5C9 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Nolc1E9Q5C9 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Nolc1E9Q5C9 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Nolc1E9Q5C9 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Nolc1E9Q5C9 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC30.16■■■□□ 2.42
Nolc1E9Q5C9 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Nolc1E9Q5C9 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
Nolc1E9Q5C9 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Nolc1E9Q5C9 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
Nolc1E9Q5C9 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
Nolc1E9Q5C9 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.41
Nolc1E9Q5C9 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Nolc1E9Q5C9 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC30.13■■■□□ 2.41
Nolc1E9Q5C9 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Nolc1E9Q5C9 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Nolc1E9Q5C9 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Nolc1E9Q5C9 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC30.11■■■□□ 2.41
Nolc1E9Q5C9 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
Nolc1E9Q5C9 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Nolc1E9Q5C9 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Nolc1E9Q5C9 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Nolc1E9Q5C9 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
Nolc1E9Q5C9 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Nolc1E9Q5C9 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
Nolc1E9Q5C9 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
Nolc1E9Q5C9 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Nolc1E9Q5C9 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Nolc1E9Q5C9 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC30.08■■■□□ 2.41
Nolc1E9Q5C9 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Nolc1E9Q5C9 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Nolc1E9Q5C9 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Nolc1E9Q5C9 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Nolc1E9Q5C9 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Nolc1E9Q5C9 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
Nolc1E9Q5C9 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Nolc1E9Q5C9 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
Nolc1E9Q5C9 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
Nolc1E9Q5C9 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Nolc1E9Q5C9 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC30.04■■■□□ 2.4
Nolc1E9Q5C9 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC30.04■■■□□ 2.4
Nolc1E9Q5C9 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
Nolc1E9Q5C9 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Nolc1E9Q5C9 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Nolc1E9Q5C9 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Nolc1E9Q5C9 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.02■■■□□ 2.4
Nolc1E9Q5C9 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
Nolc1E9Q5C9 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Nolc1E9Q5C9 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Nolc1E9Q5C9 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
Nolc1E9Q5C9 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
Nolc1E9Q5C9 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Nolc1E9Q5C9 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Nolc1E9Q5C9 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Nolc1E9Q5C9 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Nolc1E9Q5C9 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Nolc1E9Q5C9 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Nolc1E9Q5C9 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.9 ms