Protein–RNA interactions for Protein: E9Q414

Apob, Apolipoprotein B-100, mousemouse

Predictions only

Length 4,505 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ApobE9Q414 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ApobE9Q414 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ApobE9Q414 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
ApobE9Q414 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ApobE9Q414 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ApobE9Q414 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ApobE9Q414 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ApobE9Q414 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ApobE9Q414 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ApobE9Q414 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
ApobE9Q414 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ApobE9Q414 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ApobE9Q414 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ApobE9Q414 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ApobE9Q414 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ApobE9Q414 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ApobE9Q414 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ApobE9Q414 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ApobE9Q414 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ApobE9Q414 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ApobE9Q414 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ApobE9Q414 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ApobE9Q414 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ApobE9Q414 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ApobE9Q414 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ApobE9Q414 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ApobE9Q414 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ApobE9Q414 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ApobE9Q414 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ApobE9Q414 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ApobE9Q414 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ApobE9Q414 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ApobE9Q414 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ApobE9Q414 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ApobE9Q414 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ApobE9Q414 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ApobE9Q414 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ApobE9Q414 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ApobE9Q414 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ApobE9Q414 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ApobE9Q414 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ApobE9Q414 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ApobE9Q414 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ApobE9Q414 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ApobE9Q414 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ApobE9Q414 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ApobE9Q414 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ApobE9Q414 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ApobE9Q414 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
ApobE9Q414 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ApobE9Q414 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ApobE9Q414 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
ApobE9Q414 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ApobE9Q414 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ApobE9Q414 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ApobE9Q414 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ApobE9Q414 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ApobE9Q414 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ApobE9Q414 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ApobE9Q414 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
ApobE9Q414 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
ApobE9Q414 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
ApobE9Q414 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
ApobE9Q414 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
ApobE9Q414 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ApobE9Q414 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ApobE9Q414 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
ApobE9Q414 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ApobE9Q414 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ApobE9Q414 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ApobE9Q414 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC15.06■□□□□ 0
ApobE9Q414 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ApobE9Q414 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ApobE9Q414 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC15.05■□□□□ -0
ApobE9Q414 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC15.04■□□□□ -0
ApobE9Q414 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ApobE9Q414 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ApobE9Q414 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ApobE9Q414 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ApobE9Q414 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ApobE9Q414 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ApobE9Q414 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ApobE9Q414 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ApobE9Q414 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
ApobE9Q414 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
ApobE9Q414 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ApobE9Q414 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ApobE9Q414 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ApobE9Q414 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ApobE9Q414 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ApobE9Q414 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC15□□□□□ -0.01
ApobE9Q414 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
ApobE9Q414 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ApobE9Q414 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ApobE9Q414 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ApobE9Q414 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
ApobE9Q414 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ApobE9Q414 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ApobE9Q414 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ApobE9Q414 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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