Protein–RNA interactions for Protein: E9Q3L2

Pi4ka, Phosphatidylinositol 4-kinase alpha, mousemouse

Predictions only

Length 2,105 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pi4kaE9Q3L2 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Pi4kaE9Q3L2 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Pi4kaE9Q3L2 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Pi4kaE9Q3L2 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Pi4kaE9Q3L2 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Pi4kaE9Q3L2 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Pi4kaE9Q3L2 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Pi4kaE9Q3L2 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Pi4kaE9Q3L2 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Pi4kaE9Q3L2 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Pi4kaE9Q3L2 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Pi4kaE9Q3L2 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Pi4kaE9Q3L2 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Pi4kaE9Q3L2 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Pi4kaE9Q3L2 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Pi4kaE9Q3L2 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Pi4kaE9Q3L2 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Pi4kaE9Q3L2 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Pi4kaE9Q3L2 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Pi4kaE9Q3L2 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Pi4kaE9Q3L2 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Pi4kaE9Q3L2 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Pi4kaE9Q3L2 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Pi4kaE9Q3L2 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Pi4kaE9Q3L2 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Pi4kaE9Q3L2 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Pi4kaE9Q3L2 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Pi4kaE9Q3L2 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Pi4kaE9Q3L2 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Pi4kaE9Q3L2 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Pi4kaE9Q3L2 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Pi4kaE9Q3L2 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Pi4kaE9Q3L2 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Pi4kaE9Q3L2 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Pi4kaE9Q3L2 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Pi4kaE9Q3L2 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Pi4kaE9Q3L2 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Pi4kaE9Q3L2 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Pi4kaE9Q3L2 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Pi4kaE9Q3L2 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Pi4kaE9Q3L2 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Pi4kaE9Q3L2 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Pi4kaE9Q3L2 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Pi4kaE9Q3L2 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Pi4kaE9Q3L2 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Pi4kaE9Q3L2 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Pi4kaE9Q3L2 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Pi4kaE9Q3L2 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Pi4kaE9Q3L2 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Pi4kaE9Q3L2 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Pi4kaE9Q3L2 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Pi4kaE9Q3L2 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Pi4kaE9Q3L2 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Pi4kaE9Q3L2 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Pi4kaE9Q3L2 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Pi4kaE9Q3L2 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Pi4kaE9Q3L2 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Pi4kaE9Q3L2 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Pi4kaE9Q3L2 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Pi4kaE9Q3L2 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Pi4kaE9Q3L2 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Pi4kaE9Q3L2 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Pi4kaE9Q3L2 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Pi4kaE9Q3L2 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Pi4kaE9Q3L2 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Pi4kaE9Q3L2 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Pi4kaE9Q3L2 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Pi4kaE9Q3L2 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Pi4kaE9Q3L2 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Pi4kaE9Q3L2 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Pi4kaE9Q3L2 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Pi4kaE9Q3L2 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Pi4kaE9Q3L2 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Pi4kaE9Q3L2 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Pi4kaE9Q3L2 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Pi4kaE9Q3L2 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Pi4kaE9Q3L2 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Pi4kaE9Q3L2 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Pi4kaE9Q3L2 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Pi4kaE9Q3L2 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Pi4kaE9Q3L2 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Pi4kaE9Q3L2 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Pi4kaE9Q3L2 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Pi4kaE9Q3L2 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Pi4kaE9Q3L2 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Pi4kaE9Q3L2 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Pi4kaE9Q3L2 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Pi4kaE9Q3L2 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Pi4kaE9Q3L2 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Pi4kaE9Q3L2 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Pi4kaE9Q3L2 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Pi4kaE9Q3L2 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Pi4kaE9Q3L2 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Pi4kaE9Q3L2 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Pi4kaE9Q3L2 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Pi4kaE9Q3L2 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Pi4kaE9Q3L2 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Pi4kaE9Q3L2 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Pi4kaE9Q3L2 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Pi4kaE9Q3L2 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.8 ms