Protein–RNA interactions for Protein: E9Q236

Abcc4, ATP-binding cassette, sub-family C (CFTR/MRP), member 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcc4E9Q236 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Abcc4E9Q236 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Abcc4E9Q236 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Abcc4E9Q236 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC29.51■■■□□ 2.32
Abcc4E9Q236 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
Abcc4E9Q236 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC29.5■■■□□ 2.31
Abcc4E9Q236 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
Abcc4E9Q236 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
Abcc4E9Q236 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
Abcc4E9Q236 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Abcc4E9Q236 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Abcc4E9Q236 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Abcc4E9Q236 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC29.45■■■□□ 2.3
Abcc4E9Q236 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Abcc4E9Q236 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
Abcc4E9Q236 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
Abcc4E9Q236 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Abcc4E9Q236 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Abcc4E9Q236 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Abcc4E9Q236 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
Abcc4E9Q236 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Abcc4E9Q236 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Abcc4E9Q236 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Abcc4E9Q236 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Abcc4E9Q236 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Abcc4E9Q236 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Abcc4E9Q236 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Abcc4E9Q236 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Abcc4E9Q236 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Abcc4E9Q236 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Abcc4E9Q236 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Abcc4E9Q236 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Abcc4E9Q236 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
Abcc4E9Q236 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Abcc4E9Q236 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Abcc4E9Q236 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Abcc4E9Q236 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Abcc4E9Q236 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Abcc4E9Q236 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Abcc4E9Q236 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
Abcc4E9Q236 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Abcc4E9Q236 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Abcc4E9Q236 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Abcc4E9Q236 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Abcc4E9Q236 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Abcc4E9Q236 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
Abcc4E9Q236 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Abcc4E9Q236 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Abcc4E9Q236 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Abcc4E9Q236 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Abcc4E9Q236 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Abcc4E9Q236 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Abcc4E9Q236 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Abcc4E9Q236 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Abcc4E9Q236 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Abcc4E9Q236 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Abcc4E9Q236 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Abcc4E9Q236 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Abcc4E9Q236 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Abcc4E9Q236 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Abcc4E9Q236 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC29.26■■■□□ 2.27
Abcc4E9Q236 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
Abcc4E9Q236 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Abcc4E9Q236 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Abcc4E9Q236 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Abcc4E9Q236 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Abcc4E9Q236 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Abcc4E9Q236 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Abcc4E9Q236 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Abcc4E9Q236 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Abcc4E9Q236 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Abcc4E9Q236 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Abcc4E9Q236 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Abcc4E9Q236 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
Abcc4E9Q236 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Abcc4E9Q236 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Abcc4E9Q236 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Abcc4E9Q236 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Abcc4E9Q236 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Abcc4E9Q236 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.25
Abcc4E9Q236 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Abcc4E9Q236 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Abcc4E9Q236 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Abcc4E9Q236 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Abcc4E9Q236 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Abcc4E9Q236 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Abcc4E9Q236 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Abcc4E9Q236 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Abcc4E9Q236 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Abcc4E9Q236 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Abcc4E9Q236 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Abcc4E9Q236 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Abcc4E9Q236 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Abcc4E9Q236 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Abcc4E9Q236 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Abcc4E9Q236 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Abcc4E9Q236 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Abcc4E9Q236 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Abcc4E9Q236 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Abcc4E9Q236 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms