Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1L0

Vmn2r80, Vomeronasal 2, receptor 80, mousemouse

Predictions only

Length 863 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn2r80E9Q1L0 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Vmn2r80E9Q1L0 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Vmn2r80E9Q1L0 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Vmn2r80E9Q1L0 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Vmn2r80E9Q1L0 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Vmn2r80E9Q1L0 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Vmn2r80E9Q1L0 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Vmn2r80E9Q1L0 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Vmn2r80E9Q1L0 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Vmn2r80E9Q1L0 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Vmn2r80E9Q1L0 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Vmn2r80E9Q1L0 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Vmn2r80E9Q1L0 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Vmn2r80E9Q1L0 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Vmn2r80E9Q1L0 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Vmn2r80E9Q1L0 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Vmn2r80E9Q1L0 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Vmn2r80E9Q1L0 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Vmn2r80E9Q1L0 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Vmn2r80E9Q1L0 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Vmn2r80E9Q1L0 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Vmn2r80E9Q1L0 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Vmn2r80E9Q1L0 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Vmn2r80E9Q1L0 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Vmn2r80E9Q1L0 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Vmn2r80E9Q1L0 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Vmn2r80E9Q1L0 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Vmn2r80E9Q1L0 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Vmn2r80E9Q1L0 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Vmn2r80E9Q1L0 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Vmn2r80E9Q1L0 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Vmn2r80E9Q1L0 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Vmn2r80E9Q1L0 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Vmn2r80E9Q1L0 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Vmn2r80E9Q1L0 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Vmn2r80E9Q1L0 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Vmn2r80E9Q1L0 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Vmn2r80E9Q1L0 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Vmn2r80E9Q1L0 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Vmn2r80E9Q1L0 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Vmn2r80E9Q1L0 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Vmn2r80E9Q1L0 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Vmn2r80E9Q1L0 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Vmn2r80E9Q1L0 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Vmn2r80E9Q1L0 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Vmn2r80E9Q1L0 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Vmn2r80E9Q1L0 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Vmn2r80E9Q1L0 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Vmn2r80E9Q1L0 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Vmn2r80E9Q1L0 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Vmn2r80E9Q1L0 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Vmn2r80E9Q1L0 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Vmn2r80E9Q1L0 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Vmn2r80E9Q1L0 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Vmn2r80E9Q1L0 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Vmn2r80E9Q1L0 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Vmn2r80E9Q1L0 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Vmn2r80E9Q1L0 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Vmn2r80E9Q1L0 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Vmn2r80E9Q1L0 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Vmn2r80E9Q1L0 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Vmn2r80E9Q1L0 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Vmn2r80E9Q1L0 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Vmn2r80E9Q1L0 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Vmn2r80E9Q1L0 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Vmn2r80E9Q1L0 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Vmn2r80E9Q1L0 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Vmn2r80E9Q1L0 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Vmn2r80E9Q1L0 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Vmn2r80E9Q1L0 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Vmn2r80E9Q1L0 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Vmn2r80E9Q1L0 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Vmn2r80E9Q1L0 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Vmn2r80E9Q1L0 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Vmn2r80E9Q1L0 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Vmn2r80E9Q1L0 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Vmn2r80E9Q1L0 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Vmn2r80E9Q1L0 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
Vmn2r80E9Q1L0 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Vmn2r80E9Q1L0 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Vmn2r80E9Q1L0 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Vmn2r80E9Q1L0 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Vmn2r80E9Q1L0 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Vmn2r80E9Q1L0 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Vmn2r80E9Q1L0 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Vmn2r80E9Q1L0 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Vmn2r80E9Q1L0 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Vmn2r80E9Q1L0 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Vmn2r80E9Q1L0 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Vmn2r80E9Q1L0 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Vmn2r80E9Q1L0 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Vmn2r80E9Q1L0 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Vmn2r80E9Q1L0 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Vmn2r80E9Q1L0 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Vmn2r80E9Q1L0 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Vmn2r80E9Q1L0 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Vmn2r80E9Q1L0 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Vmn2r80E9Q1L0 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Vmn2r80E9Q1L0 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Vmn2r80E9Q1L0 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms