Protein–RNA interactions for Protein: E9PWG2

Trappc8, Trafficking protein particle complex 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc8E9PWG2 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
Trappc8E9PWG2 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
Trappc8E9PWG2 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC36.43■■■■□ 3.42
Trappc8E9PWG2 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
Trappc8E9PWG2 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC36.43■■■■□ 3.42
Trappc8E9PWG2 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
Trappc8E9PWG2 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
Trappc8E9PWG2 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC36.42■■■■□ 3.42
Trappc8E9PWG2 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
Trappc8E9PWG2 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
Trappc8E9PWG2 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
Trappc8E9PWG2 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
Trappc8E9PWG2 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
Trappc8E9PWG2 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
Trappc8E9PWG2 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
Trappc8E9PWG2 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC36.35■■■■□ 3.41
Trappc8E9PWG2 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
Trappc8E9PWG2 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
Trappc8E9PWG2 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.32■■■■□ 3.41
Trappc8E9PWG2 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.4
Trappc8E9PWG2 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.4
Trappc8E9PWG2 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
Trappc8E9PWG2 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.31■■■■□ 3.4
Trappc8E9PWG2 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
Trappc8E9PWG2 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
Trappc8E9PWG2 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
Trappc8E9PWG2 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC36.29■■■■□ 3.4
Trappc8E9PWG2 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.28■■■■□ 3.4
Trappc8E9PWG2 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
Trappc8E9PWG2 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
Trappc8E9PWG2 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
Trappc8E9PWG2 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
Trappc8E9PWG2 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
Trappc8E9PWG2 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
Trappc8E9PWG2 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
Trappc8E9PWG2 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC36.23■■■■□ 3.39
Trappc8E9PWG2 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC36.22■■■■□ 3.39
Trappc8E9PWG2 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC36.21■■■■□ 3.39
Trappc8E9PWG2 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
Trappc8E9PWG2 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
Trappc8E9PWG2 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
Trappc8E9PWG2 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
Trappc8E9PWG2 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.38
Trappc8E9PWG2 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC36.19■■■■□ 3.38
Trappc8E9PWG2 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC36.19■■■■□ 3.38
Trappc8E9PWG2 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
Trappc8E9PWG2 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.17■■■■□ 3.38
Trappc8E9PWG2 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
Trappc8E9PWG2 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
Trappc8E9PWG2 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
Trappc8E9PWG2 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC36.15■■■■□ 3.38
Trappc8E9PWG2 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC36.14■■■■□ 3.38
Trappc8E9PWG2 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.14■■■■□ 3.38
Trappc8E9PWG2 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC36.13■■■■□ 3.37
Trappc8E9PWG2 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
Trappc8E9PWG2 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC36.12■■■■□ 3.37
Trappc8E9PWG2 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
Trappc8E9PWG2 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
Trappc8E9PWG2 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
Trappc8E9PWG2 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC36.09■■■■□ 3.37
Trappc8E9PWG2 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
Trappc8E9PWG2 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC36.08■■■■□ 3.37
Trappc8E9PWG2 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC36.08■■■■□ 3.37
Trappc8E9PWG2 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC36.08■■■■□ 3.37
Trappc8E9PWG2 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC36.08■■■■□ 3.37
Trappc8E9PWG2 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC36.08■■■■□ 3.37
Trappc8E9PWG2 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.37
Trappc8E9PWG2 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.07■■■■□ 3.36
Trappc8E9PWG2 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
Trappc8E9PWG2 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
Trappc8E9PWG2 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
Trappc8E9PWG2 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
Trappc8E9PWG2 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
Trappc8E9PWG2 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
Trappc8E9PWG2 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC36.04■■■■□ 3.36
Trappc8E9PWG2 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC36.04■■■■□ 3.36
Trappc8E9PWG2 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
Trappc8E9PWG2 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
Trappc8E9PWG2 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
Trappc8E9PWG2 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC36.01■■■■□ 3.36
Trappc8E9PWG2 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
Trappc8E9PWG2 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC36■■■■□ 3.35
Trappc8E9PWG2 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC35.99■■■■□ 3.35
Trappc8E9PWG2 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC35.98■■■■□ 3.35
Trappc8E9PWG2 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
Trappc8E9PWG2 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
Trappc8E9PWG2 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
Trappc8E9PWG2 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
Trappc8E9PWG2 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC35.97■■■■□ 3.35
Trappc8E9PWG2 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
Trappc8E9PWG2 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC35.96■■■■□ 3.35
Trappc8E9PWG2 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC35.96■■■■□ 3.35
Trappc8E9PWG2 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
Trappc8E9PWG2 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC35.94■■■■□ 3.34
Trappc8E9PWG2 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC35.94■■■■□ 3.34
Trappc8E9PWG2 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
Trappc8E9PWG2 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC35.92■■■■□ 3.34
Trappc8E9PWG2 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
Trappc8E9PWG2 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
Trappc8E9PWG2 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.92■■■■□ 3.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms