Protein–RNA interactions for Protein: E0CZ16

Klhl3, Kelch-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 587 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl3E0CZ16 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Klhl3E0CZ16 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Klhl3E0CZ16 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Klhl3E0CZ16 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Klhl3E0CZ16 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Klhl3E0CZ16 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Klhl3E0CZ16 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Klhl3E0CZ16 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Klhl3E0CZ16 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Klhl3E0CZ16 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Klhl3E0CZ16 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Klhl3E0CZ16 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Klhl3E0CZ16 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Klhl3E0CZ16 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Klhl3E0CZ16 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Klhl3E0CZ16 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Klhl3E0CZ16 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Klhl3E0CZ16 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Klhl3E0CZ16 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Klhl3E0CZ16 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Klhl3E0CZ16 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Klhl3E0CZ16 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Klhl3E0CZ16 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Klhl3E0CZ16 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Klhl3E0CZ16 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Klhl3E0CZ16 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Klhl3E0CZ16 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Klhl3E0CZ16 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Klhl3E0CZ16 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Klhl3E0CZ16 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Klhl3E0CZ16 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Klhl3E0CZ16 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Klhl3E0CZ16 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Klhl3E0CZ16 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Klhl3E0CZ16 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Klhl3E0CZ16 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Klhl3E0CZ16 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Klhl3E0CZ16 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Klhl3E0CZ16 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Klhl3E0CZ16 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Klhl3E0CZ16 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Klhl3E0CZ16 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Klhl3E0CZ16 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Klhl3E0CZ16 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Klhl3E0CZ16 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Klhl3E0CZ16 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Klhl3E0CZ16 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Klhl3E0CZ16 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Klhl3E0CZ16 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Klhl3E0CZ16 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Klhl3E0CZ16 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Klhl3E0CZ16 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Klhl3E0CZ16 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Klhl3E0CZ16 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Klhl3E0CZ16 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Klhl3E0CZ16 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Klhl3E0CZ16 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Klhl3E0CZ16 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Klhl3E0CZ16 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Klhl3E0CZ16 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Klhl3E0CZ16 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Klhl3E0CZ16 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Klhl3E0CZ16 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Klhl3E0CZ16 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Klhl3E0CZ16 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Klhl3E0CZ16 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Klhl3E0CZ16 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.27
Klhl3E0CZ16 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Klhl3E0CZ16 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Klhl3E0CZ16 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Klhl3E0CZ16 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Klhl3E0CZ16 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Klhl3E0CZ16 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
Klhl3E0CZ16 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Klhl3E0CZ16 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Klhl3E0CZ16 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Klhl3E0CZ16 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Klhl3E0CZ16 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Klhl3E0CZ16 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Klhl3E0CZ16 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Klhl3E0CZ16 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Klhl3E0CZ16 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Klhl3E0CZ16 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Klhl3E0CZ16 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Klhl3E0CZ16 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Klhl3E0CZ16 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Klhl3E0CZ16 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Klhl3E0CZ16 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Klhl3E0CZ16 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Klhl3E0CZ16 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Klhl3E0CZ16 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Klhl3E0CZ16 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Klhl3E0CZ16 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Klhl3E0CZ16 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Klhl3E0CZ16 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Klhl3E0CZ16 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Klhl3E0CZ16 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Klhl3E0CZ16 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Klhl3E0CZ16 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Klhl3E0CZ16 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.2 ms